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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002695`

染色体: Chr06 坐标: 38873357-38875155 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002695`
名称	SmilChr06G002695
描述	uncharacterized SmilChr06G002695
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	38873357 - 38875155 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989433`
GeneID	`130989433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989433`
原始查询	`LOC130989433`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0551900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0551900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0551900` - identity=25.9; qcov=0.609; evalue=9.9e-06; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0016926 (protein desumoylation); GO:0016929 (deSUMOylase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769420.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769420.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769420.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769420.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769420.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:38873880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	29	A15,A25,A5,B120,B134,B14,B21,B22,B27,B5,B66,B70,B79,C10,C12,C14,C27,C3,C31,C4,C40,C44,C55,C75,C76,C84,C86,D4,D8
`Chr6:38873900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr6:38873905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:38873911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr6:38874049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B110
`Chr6:38874086`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C71
`Chr6:38874086`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C71
`Chr6:38874090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:38874093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B5,B81,D10
`Chr6:38874116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B22
`Chr6:38874116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr6:38874125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769420.1

235 aa

118

235

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 97-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769420.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	97	226	3e-14	54.1	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913437.1
AGAAGACACGTGGAAAAAAGATTTTGAAAGAGTCCGCGGTGAAGAATTTGTCATCATTGCCTTCATCATTAGTAGCACTATACTGTATGATGGAGAAGTCATTCGCGGGTGAAGGAATACATCTTCCAATAGACTTTGAAATGTTTGGGCAAGATCTAAAAATTTGGATTCTCTTGAAGGATGATGTGATTCCCTTTTGTAATCTGGAACCGATTACAGGGAACAGCATTATCGCATACATTTGCCATTCTTATGGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989433
ATGATGGAGAAGTCATTCGCGGGTGAAGGAATACATCTTCCAATAGACTTTGAAATGTTTGGGCAAGATCTAAAAATTTGGATTCTCTTGAAGGATGATGTGATTCCCTTTTGTAATCTGGAACCGATTACAGGGAACAGCATTATCGCATACATTTGCCATTCTTATGGAAAGATGAAGACAGAGGGAACTCTTGGGAGGTTTATGTTTGTGAATCCATTTACCGTATCTCAAAATCGACAAGACTCAACCGAGACAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769420.1
MMEKSFAGEGIHLPIDFEMFGQDLKIWILLKDDVIPFCNLEPITGNSIIAYICHSYGKMKTEGTLGRFMFVNPFTVSQNRQDSTETRARKLADRLLQALSNQLVLVPCNVGGHWILTIIDLEKDRVSLMDPISHRNKDTPWKLVVDTAMNIVNARKGKKFKKTASWEVVKGPIQPDASQCGFYVMKFMKEIIARYELNAYTSLSSMFKNVKTYTEAEIDDIREEWATFVIKHVFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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