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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002707`

染色体: Chr06 坐标: 39072922-39074355 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002707`
名称	SmilChr06G002707
描述	pre-mRNA-splicing factor 38-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39072922 - 39074355 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989440`
GeneID	`130989440`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989440`
原始查询	`LOC130989440`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-splicing factor 38-like
产物	pre-mRNA-splicing factor 38-like
Arabidopsis	`AT2G40650` (AT2G40650) PRP38 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818660] identity=84.6; qcov=0.889; evalue=3.58e-105; confidence=high
Rice	`Os09g0103600` - identity=82.9; qcov=0.895; evalue=5.42e-103; confidence=high
GO	GO:0071011 (precatalytic spliceosome)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03371 (PRP38)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989440

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769429.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769429.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057769429.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769429.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39073095`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A7,B113,B127,B132,B133,B24,B4,B42,B43,B50,B60,B61,B62,B68,B72,C3,C38,C43,C47,C71,C85,D7
`Chr6:39073097`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A10,A11,A24,A7,B102,B110,B113,B129,B132,B133,B20,B23,B24,B31,B4,B42,B43,B46,B50,B61,B62,B63,B68,B72,B83,B86,B88,B93,B94,B98,C12,C13,C33,C42,C43,C47,C50,C58,C71,C85,D10
`Chr6:39073110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B13,B24
`Chr6:39073110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B24
`Chr6:39073127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B110,B46,D6
`Chr6:39073142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:39073342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr6:39073347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B104
`Chr6:39073363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B39,B65,B95,C49
`Chr6:39073382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:39073393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B58,C31,C73
`Chr6:39073412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769429.1

190 aa

190

PRP38

PF03371 PRP38 10-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769429.1`	Pfam	`PF03371`	PRP38	Family	10	169	1.6e-63	214.3	PRP38 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913446.1
TATTTCAGTCAGACAAAACCAATGAGTTCCGGCATTATATAAAGTAAAAGAGCCCTCTGAAATTGGGAATTAGGTTTTCGGCCAAAATCTCCGATTATCAGCTACATTTTTCTTTTTCATGGCGAATCGAACAGACCCCCTCGCTAAAAGCATAAGAGGTACAAACCCCCAAAATCTGGTGGAGAAGATTTTGCGCACGAAGATCTACCAAAATACTTACTGGAAGGAGCAATGCTTCGGGCTGACGGCGGAGACGCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989440
ATGGCGAATCGAACAGACCCCCTCGCTAAAAGCATAAGAGGTACAAACCCCCAAAATCTGGTGGAGAAGATTTTGCGCACGAAGATCTACCAAAATACTTACTGGAAGGAGCAATGCTTCGGGCTGACGGCGGAGACGCTCGTCGACAAGGCCATGGAGCTCGACCACCTCGGCGGAACTCACGGTGGCACCCGGAAACCCACCCATTTTATGTGCCTTGTTATGAAGATGCTCCAGATTCAGCCCGACAAGGAAATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769429.1
MANRTDPLAKSIRGTNPQNLVEKILRTKIYQNTYWKEQCFGLTAETLVDKAMELDHLGGTHGGTRKPTHFMCLVMKMLQIQPDKEIVVEFIKNLEYKYVRVLGAFYLRLTRMDVDVYRYLEPLYNNYRKLRLKLNDGKFTLTHVDEYIDELLTKDYSCDIALPRIKKRYLKCNVGRVLMVFVCSFILAFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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