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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002715`

染色体: Chr06 坐标: 39230951-39235872 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002715`
名称	SmilChr06G002715
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	39230951 - 39235872 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989441`
GeneID	`130989441`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989441`
原始查询	`LOC130989441`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 5-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 5-like
Arabidopsis	`AT1G63800` (UBC5) ubiquitin-conjugating enzyme 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842683] identity=71.7; qcov=1; evalue=5.1e-99; confidence=high
Rice	`Os10g0447100` (OsUBC10) - identity=84.3; qcov=0.749; evalue=1.28e-87; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989441

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769431.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769431.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769431.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769431.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:39234555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:39235379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr6:39235617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr6:39235670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C51,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769431.1

187 aa

187

UQ_con

PF00179 UQ_con 11-142 aa

XP_057769432.1

187 aa

187

UQ_con

PF00179 UQ_con 11-142 aa

XP_057769433.1

187 aa

187

UQ_con

PF00179 UQ_con 11-142 aa

XP_057769434.1

187 aa

187

UQ_con

PF00179 UQ_con 11-142 aa

XP_057769435.1

187 aa

187

UQ_con

PF00179 UQ_con 11-142 aa

XP_057769436.1

187 aa

187

UQ_con

PF00179 UQ_con 11-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769431.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	11	142	1.8e-41	141.7	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057769432.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	11	142	1.8e-41	141.7	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057769433.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	11	142	1.8e-41	141.7	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057769434.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	11	142	1.8e-41	141.7	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057769435.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	11	142	1.8e-41	141.7	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057769436.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	11	142	1.8e-41	141.7	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913452.1
AAGGGAAAAAGAACTCGTTGACCCAGCCTCAAAGAAGTCGGACCCCAAGTTCCCAACCCACCACCCTCTTCCTCCTTCCTCTCGCCGAGTCGCGACCCTTCTCTCCCTCTTCATTCCCTTTCTTTCTTCTCGCCTTTCTCCCTCCGCCGCCTTCATTTCTTCTTCTCTGTATCTGACACTTCATTCGATCTCGCCTTCGTCTCTCTCTCCCATACCTCCTTTAGCTTCTTCTCTGTAATTGCAATCTAACCTCCTTCGAT...

XM_057913450.1
AAGGGAAAAAGAACTCGTTGACCCAGCCTCAAAGAAGTCGGACCCCAAGTTCCCAACCCACCACCCTCTTCCTCCTTCCTCTCGCCGAGTCGCGACCCTTCTCTCCCTCTTCATTCCCTTTCTTTCTTCTCGCCTTTCTCCCTCCGCCGCCTTCATTTCTTCTTCTCTGTATCTGACACTTCATTCGATCTCGCCTTCGTCTCTCTCTCCCATACCTCCTTTAGCTTCTTCTCTGTAATTGCAATCTAACCTCCTTCGAT...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC130989441
ATGTCTTCTCCCAGCAAGAGGCGTGACATGGATGTCATGAAATTAATGATGAGTGACTACACTGTGGAGCCCATAAATGATGGCATCAACGAGTTCAATGTGGAATTTCATGGCCCAAAAGAAAGTCCGTACGAAGGTGGTGTTTGGAAAGTTCGCGTGGAACTTCCAGATGCTTATCCCTACAAATCTCCGTCAATCGGGTTTGTCAACAAAATCTTCCACCCCAATGTTGACGAGCTGTCGGGCTCGGTATGCTTGGA...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057769431.1
MSSPSKRRDMDVMKLMMSDYTVEPINDGINEFNVEFHGPKESPYEGGVWKVRVELPDAYPYKSPSIGFVNKIFHPNVDELSGSVCLDVINQSWSPMFDLLNVFEVFLPQLLLYPNPSDPLNGDAASLMMKDKAQYEQKVKEYCDRYAKKQHAENSVSDESEDEVSDNEAYSDGRSDSDDEVAGRADP

XP_057769432.1
MSSPSKRRDMDVMKLMMSDYTVEPINDGINEFNVEFHGPKESPYEGGVWKVRVELPDAYPYKSPSIGFVNKIFHPNVDELSGSVCLDVINQSWSPMFDLLNVFEVFLPQLLLYPNPSDPLNGDAASLMMKDKAQYEQKVKEYCDRYAKKQHAENSVSDESEDEVSDNEAYSDGRSDSDDEVAGRADP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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