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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002605`

染色体: Chr06 坐标: 37431769-37435889 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002605`
名称	SmilChr06G002605
描述	pre-mRNA-splicing factor clf1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	37431769 - 37435889 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989446`
GeneID	`130989446`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989446`
原始查询	`LOC130989446`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-splicing factor clf1-like
产物	pre-mRNA-splicing factor clf1-like
Arabidopsis	`AT5G41770` (AT5G41770) crooked neck protein, putative / cell cycle protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834182] identity=82.6; qcov=0.612; evalue=1.53e-56; confidence=high
Rice	`Os05g0289400` (P0587F01.11) - identity=71.6; qcov=0.612; evalue=1.19e-49; confidence=medium
GO	GO:0000245 (spliceosomal complex assembly); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0000974 (Prp19 complex); GO:0005515 (protein binding); GO:0071007 (U2-type catalytic step 2 spliceosome); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071014 (post-mRNA release spliceosomal complex)
KEGG	-
Pfam	PF23240 (HAT_PRP39_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989446

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769441.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057769441.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057769441.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057769441.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769441.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:37431866`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A24,A9,B106,B107,B113,B52,B54,B71,C18,C46,C65
`Chr6:37432111`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B40,B78,C23,C37,D11
`Chr6:37432111`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B40,B78,C23,C37,D11
`Chr6:37432321`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A3,B114,B136,B29,B37,B44,B74,B97,C16,C34,C36,C40,C44,D8
`Chr6:37432410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:37432579`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:37432663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C50
`Chr6:37432663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr6:37432664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A16,B11,B118,B138,B41,B47,B67,B73,B76,B89,C22,C26,C3,C55,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769441.1

178 aa

178

HAT_PRP39_N

PF23240 HAT_PRP39_N 47-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769441.1`	Pfam	`PF23240`	HAT_PRP39_N	Repeat	47	127	2e-09	38.5	PRP39 N-terminal HAT repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913458.1
ATACCACAACAATTCAGTTCGTGTTGTATACATGTTTGGTTCATAATCTTGTGACGTGAACTTTAAATTTATTATGTATGAATCCAATAATAAATTCATGGAATCATATTACTTAAAAAATCCGTGTTATACTATAAGTAAAACCAGGGGTCAAAGTTTAAAGCATGAGTGAAGGAATAGTATCATAATTTGTAGGTTACAACAGTATGAATTACAAAAATAAATGTATGAATCATGTAAATTCGTGATGAATTATAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989446
ATGTTTTGGCAGCTTGCAATGGCCGCACAATTTGAAATGCGACAATTAAATATTGATCGGGCTCGGAAAATATTGGGGTCAGCAATTGGTATGGCTCCCAAAGACAAGATCTTTAAGAAGTATATAGAGATAGAGCTGCAACTTGGTAACCTAGAACGATGTAGGAAACTTTACAAAAAATACTTGGAGTGGTCTCCCAAGAACTATTATGCATGGAGCAAGTATGCCGAGTTGGAGAGATCCTTGTCAGAAACTGAACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769441.1
MFWQLAMAAQFEMRQLNIDRARKILGSAIGMAPKDKIFKKYIEIELQLGNLERCRKLYKKYLEWSPKNYYAWSKYAELERSLSETERARALLELAIDQPTLDMPELLWKAYIDFEKLKKRRHIETEDAPAGYEEYIDYLFPQETQTINLKFLEAAYKWKKQKIVSCYYFLPNDKYISF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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