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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002789`

染色体: Chr06 坐标: 40575138-40578506 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002789`
名称	SmilChr06G002789
描述	aquaporin NIP2-1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	40575138 - 40578506 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989537`
GeneID	`130989537`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989537`
原始查询	`LOC130989537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin NIP2-1-like
产物	aquaporin NIP2-1-like
Arabidopsis	`AT5G37820` (NIP4;2) NOD26-like intrinsic protein 4;2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833760] identity=49.4; qcov=0.881; evalue=1.08e-75; confidence=high
Rice	`Os02g0745100` (LSI1) - identity=64.9; qcov=0.942; evalue=1.95e-121; confidence=high
GO	GO:0015267 (channel activity); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989537

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769493.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057769494.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769493.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769493.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769493.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:40575282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:40575335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:40575372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C18
`Chr6:40575829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B21,C11,C20
`Chr6:40578473`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A20,A22,A24,A4,A6,A7,A9,B10,B110,B111,B114,B117,B122,B137,B15,B17,B19,B21,B27,B29,B37,B44,B47,B50,B51,B54,B57,B6,B60,B62,B68,B69,B73,B77,B88,B9,C1,C12,C26,C33,C41,C49,C50,C53,C59,C61,C67,C84,D2,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769493.1

280 aa

140

280

MIP

PF00230 MIP 30-240 aa

XP_057769494.1

278 aa

139

278

MIP

PF00230 MIP 30-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769493.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	30	240	3.6e-54	184.6	Major intrinsic protein
`XP_057769494.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	30	238	8.7e-56	189.9	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913511.1
ATGAAAAACCTCATATCGCATCTTGAAAAAAAATGGAGAATGGAGGTGGGGCCGTGCCTGTTGAGAATCCCAAACTCAGTGCCACCATTCCCACCTTCTTCAAAAACAATTACCCACCAGATTTTCTCAAAAAGGTAATTGCGGAAATAATAGCGACATACCTATTGGTGTTTGTGACATGTGGTGCAGCAGCTGTTAGTGGTAGCGATGAACACAAGGTTTCAAGGCTCGGAGCTTCCGTCGCTGGTGGCCTCATCGTC...

XM_057913510.1
ATGAAAAACCTCATATCGCATCTTGAAAAAAAATGGAGAATGGAGGTGGGGCCGTGCCTGTTGAGAATCCCAAACTCAGTGCCACCATTCCCACCTTCTTCAAAAACAATTACCCACCAGATTTTCTCAAAAAGGTAATTGCGGAAATAATAGCGACATACCTATTGGTGTTTGTGACATGTGGTGCAGCAGCTGTTAGTGGTAGCGATGAACACAAGGTTTCAAGGCTCGGAGCTTCCGTCGCTGGTGGCCTCATCGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989537
ATGGAGAATGGAGGTGGGGCCGTGCCTGTTGAGAATCCCAAACTCAGTGCCACCATTCCCACCTTCTTCAAAAACAATTACCCACCAGATTTTCTCAAAAAGGTAATTGCGGAAATAATAGCGACATACCTATTGGTGTTTGTGACATGTGGTGCAGCAGCTGTTAGTGGTAGCGATGAACACAAGGTTTCAAGGCTCGGAGCTTCCGTCGCTGGTGGCCTCATCGTCACCGTCATGATCTACGCCGTCGGTCACATCTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769493.1
MENGGGAVPVENPKLSATIPTFFKNNYPPDFLKKVIAEIIATYLLVFVTCGAAAVSGSDEHKVSRLGASVAGGLIVTVMIYAVGHISGAHMNPAVTLAFAAVRHFPWNQMQVPFYAAAQVTGATCGGFTLRVLLQPIKHVGTTSPSGTDIQALVMEIVVTFSMMFVTSAVATDTKAVGELAGIAVGSAVCITSILAGPISGGSMNPARTIGPALASNYFKGIWVYLLGPVCGTLGGAWAYSFIRVSDKPAGELTPAPSFK...

XP_057769494.1
MENGGGAVPVENPKLSATIPTFFKNNYPPDFLKKVIAEIIATYLLVFVTCGAAAVSGSDEHKVSRLGASVAGGLIVTVMIYAVGHISGAHMNPAVTLAFAAVRHFPWNQVPFYAAAQVTGATCGGFTLRVLLQPIKHVGTTSPSGTDIQALVMEIVVTFSMMFVTSAVATDTKAVGELAGIAVGSAVCITSILAGPISGGSMNPARTIGPALASNYFKGIWVYLLGPVCGTLGGAWAYSFIRVSDKPAGELTPAPSFKLR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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