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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002827`

染色体: Chr06 坐标: 41033105-41036805 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002827`
名称	SmilChr06G002827
描述	DNA gyrase subunit B, chloroplastic/mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41033105 - 41036805 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989572`
GeneID	`130989572`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989572`
原始查询	`LOC130989572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA gyrase subunit B, chloroplastic/mitochondrial-like
产物	DNA gyrase subunit B%2C chloroplastic/mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G04130` (GYRB2) DNA GYRASE B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830291] identity=75.3; qcov=0.807; evalue=9.59e-81; confidence=high
Rice	`Os01g0268300` (GYRB) - identity=73.1; qcov=0.801; evalue=1.52e-73; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003918 (DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006265 (DNA topological change)
KEGG	-
Pfam	PF00204 (DNA_gyraseB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989572

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769527.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057769527.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769527.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769527.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769527.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41033450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr6:41033670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B83,C59
`Chr6:41033688`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	63	A1,A16,A19,A22,A6,A7,A8,B107,B111,B113,B115,B122,B129,B134,B135,B15,B18,B20,B21,B35,B37,B38,B39,B42,B43,B44,B48,B5,B56,B57,B61,B62,B7,B74,B75,B83,B86,B88,B95,B96,B98,C12,C16,C24,C32,C33,C38,C40,C43,C47,C49,C55,C6,C61,C64,C66,C67,C68,C71,C78,C79,C80,D3
`Chr6:41033785`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C47
`Chr6:41033832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:41033889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B73,D3
`Chr6:41034118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B19
`Chr6:41034425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr6:41034441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B50,C12,C81
`Chr6:41034449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:41034463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B13,B40,C51,C74
`Chr6:41034469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B69,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769527.1

181 aa

181

DNA_gyraseB

PF00204 DNA_gyraseB 75-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769527.1`	Pfam	`PF00204`	DNA_gyraseB	Domain	75	172	1.1e-25	90.9	DNA gyrase B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090696.1
CTATGTACTGTTGTCTATATCCATAGATAACGGTTTTTGAAAAACCGTTATCTTTTCGCGTTATCTATTAGTTGCATACATAACGGTATTACAAAACCGTTAAGCCACCGTTATCTATGACCATCTTTTATAACGGTTTATTCATAACGTTAAAGAACCGTTATGTATAAGAGTCATTTACAACGGTTTTGGAACCGTTATGTTTGAGCGTATCTAAAAACTGTTGTGTATAATTTTTTTTATTAATTTTTTTAAAATTA...

XR_009090695.1
TATGTACTGTTGTCTATATCCATAGATAACGGTTTTTGAAAAACCGTTATCTTTTCGCGTTATCTATTAGTTGCATACATAACGGTATTACAAAACCGTTAAGCCACCGTTATCTATGACCATCTTTTATAACGGTTTATTCATAACGTTAAAGAACCGTTATGTATAAGAGTCATTTACAACGGTTTTGGAACCGTTATGTTTGAGCGTATCTAAAAACTGTTGTGTATAATTTTTTTTATTAATTTTTTTAAAATTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989572
ATGATTTCTTTGAATTTGATTCAACAATGCTTCCTTAAAAAACATCATTTGACTAGCCTTTCTTTTACTACAATATTTACAACAGAAATTGAGTTTGACTACAACACAATATCTAGCAGAATCAGGGAGCTCGCTTTTCTAAATCCTGAGGTTACAATTGCTCTTGAGAAGCAGGATGTGGACCCAGAGAAGACGGTGCATAATGAGTACAGCTATGCTGGAGGATTAATTGAATATGTGAAGTGGCTTAATACTGATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769527.1
MISLNLIQQCFLKKHHLTSLSFTTIFTTEIEFDYNTISSRIRELAFLNPEVTIALEKQDVDPEKTVHNEYSYAGGLIEYVKWLNTDKKPLHEVVGFRKEVEGISIDIALQWCSDSYSDTLLGYANSIRTVDGGTHIDGVKASLTRTLNNLAKKSKVIKEKDITLSGEHVNSLVLVQVHYCD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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