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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002840`

染色体: Chr06 坐标: 41171906-41173379 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002840`
名称	SmilChr06G002840
描述	uncharacterized SmilChr06G002840
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41171906 - 41173379 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989587`
GeneID	`130989587`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989587`
原始查询	`LOC130989587`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0591500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0591500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G53310` (AT3G53310) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824499] identity=33; qcov=0.396; evalue=1.7e-09; confidence=low
Rice	`Os12g0591500` - identity=28; qcov=0.51; evalue=1.06e-09; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989587

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769549.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769549.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769549.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769549.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41172212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	40	A16,A18,A2,A5,A6,B1,B102,B108,B114,B119,B122,B124,B134,B14,B16,B20,B36,B4,B73,B81,B84,B86,B88,C14,C16,C17,C26,C34,C36,C42,C44,C45,C46,C48,C53,C55,C58,C62,C70,C79
`Chr6:41172235`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C62
`Chr6:41172235`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C62
`Chr6:41172277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B21,C55
`Chr6:41172486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B66,C46
`Chr6:41172506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr6:41172614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B110,B6,C22
`Chr6:41172804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B78,C64,C66
`Chr6:41172843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C82
`Chr6:41172883`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	138	A11,A13,A14,A16,A18,A2,A20,A22,A24,A25,A3,A5,A6,A9,B1,B10,B101,B102,B103,B105,B108,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B121,B122,B123,B124,B126,B129,B131,B134,B135,B137,B138,B14,B16,B18,B2,B20,B21,B24,B27,B28,B29,B31,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B44,B45,B46,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B59,B6,B60,B66,B7,B73,B74,B76,B77,B79,B8,B81,B84,B85,B86,B88,B9,B91,B94,B95,B97,B98,B99,C10,C13,C15,C16,C2,C20,C24,C26,C32,C33,C35,C36,C38,C39,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C52,C53,C55,C58,C60,C67,C68,C70,C71,C72,C76,C78,C79,C80,C81,C83,C84,C9,D1,D11,D3,D4,D5
`Chr6:41172903`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B101
`Chr6:41172903`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769549.1

245 aa

122

245

PF02362 B3 52-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769549.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	52	133	2.4e-23	82.7	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913566.1
AGAAAGGGAGCTATTTTTATTTATATATATATAAATAACATAGGAATTTAAGGCTGAAAACCCTTACTAGCGCTGAAACCAAATTTTTTTTATTAAGAAGCTGCGCTGCGCCGCTGCTACGCCTCGCTCGCACCACCACCGCCAGCCACTGCTCCGCCTCGCACCACCACCGCCGGCCACTGCTCCCTGCCCGTCTCGCACCACCAGGTCCACCACCGCTGGAGAAAACATAGAGAGGTGAATTGAAACTTTGAATTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989587
ATGGCAGCACAGCACATGGGTCGGCACTGGTCACACTCTCTTTGTAAACTCATATACATCTTCTTCTCCTCTCTCTTCTTTGTAGCGCACTCTGCAGAAATCATGGACACGATGCCCTCATTTTACAAGATCTTGATGGACCTCCCTCCCAAACTCCTATTGCCAAAGGGTTTCACGGATAAGTACGGCGAAAACTTGTCCGAAAGAGTTAGGCTAAGAAACAAGAGCGGCACCTCATGGAATGTGAGGCTCGAGAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769549.1
MAAQHMGRHWSHSLCKLIYIFFSSLFFVAHSAEIMDTMPSFYKILMDLPPKLLLPKGFTDKYGENLSERVRLRNKSGTSWNVRLEKMREEGEETDAYYFTRGWTKFSNDVDLKTFEVLVFFYAGNSTFDVTVYAVTALEKEPAGFRAAANPMCRFELKQHNYHKFHVPKDFSDACGLKQKREVRLECLGGSSARVKVNSCKGRVDFGGGLSGFFKANNFAINRTYSLEFLPAENVIRVGPDYLLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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