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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003050`

染色体: Chr01 坐标: 49460707-49465536 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003050`
名称	SmilChr01G003050
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49460707 - 49465536 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989594`
GeneID	`130989594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989594`
原始查询	`LOC130989594`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8
Arabidopsis	`AT2G03070` (MED8) mediator subunit 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814836] identity=53; qcov=1.01; evalue=2.05e-117; confidence=high
Rice	`Os03g0423800` (OsMed8_1) - identity=69.9; qcov=0.322; evalue=5.09e-64; confidence=low
GO	GO:0016592 (mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF28579 (MED8_mid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769561.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057769561.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057769571.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769561.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769561.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49463371`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:49463865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr1:49464378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B79,C43,C71,D1
`Chr1:49465331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769561.1

546 aa

273

546

MED8_mid

PF28579 MED8_mid 30-177 aa

XP_057769571.1

444 aa

222

444

MED8_mid

PF28579 MED8_mid 9-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769561.1`	Pfam	`PF28579`	MED8_mid	Domain	30	177	2e-82	275.2	Mediator subunit 8 middle domain
`XP_057769571.1`	Pfam	`PF28579`	MED8_mid	Domain	9	75	1.4e-31	110.2	Mediator subunit 8 middle domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913578.1
TAAATTATGATAATTTAATTTGATTTGATTTTAATATGAACTGGATGCTGTATTTTTGAACTGAATTTATTAACCTTTTTTTCCTTCGAAGAATTGACTCATTGACGCTGAGGATATATTAACCGGAATTCTCAACCCTCACCCGGCCGCCCACGGCGGAGCTCCGATCAAATATTAATGGCAGCTGCGGAAGCAGCAGTGGTGGCGGCTGGCCAAGACCAGCAACAACCGCCGCCGGCGAAGGCTGTGGAGCGGCTGAA...

XM_057913588.1
TAACCTTTTGATTTCAGTTGTTTATTCTGGTTATTTTTCCTTGTGACCAAGCATTTGCTATAAGGTCGCTAAAAGTTTATAGGAAATGCTTGCTTATATGATTGCATCACTGTAAGACATAAAAAGGCTATGTGGGAGATTGAGAAAGGCAAAGCTGTTCTGCCTGTTATGCTGTCATCTAAGCTTTTGCCGGAAATGGAGATGGAAGACAACACTAAGAGAGAACAGCTGTTGCATGGTATGCAGGGCCTGCCAGTGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989594
ATGGCAGCTGCGGAAGCAGCAGTGGTGGCGGCTGGCCAAGACCAGCAACAACCGCCGCCGGCGAAGGCTGTGGAGCGGCTGAACTCGGCGCTTCAGCAGCAGCTCAACCTCGACTCTGTAAAGACTCGCGCTATCAGCCTCTTCAAAGCCATCTCTCGGATCCTCGAAGAATTAGATGCCATAGCGCGCGCGAATGCCACCCCCAAATGGCAAGATGTTTTGGGGCAGTTCTCGATGGTAAATCTGGAGCTGTACAATAT...

LOC130989594
ATGTGGGAGATTGAGAAAGGCAAAGCTGTTCTGCCTGTTATGCTGTCATCTAAGCTTTTGCCGGAAATGGAGATGGAAGACAACACTAAGAGAGAACAGCTGTTGCATGGTATGCAGGGCCTGCCAGTGGTGGCACAAATTGACAAGCTCAAGACTAGAATTGATATGATTGGAGCAGCCTGTGAAAGTGCTGAGAAGATCATAGCTGATGCGCGTAAAACCTACTTTGGCACTCGGCAGGGGACAAATCTTCTCCCAAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769561.1
MAAAEAAVVAAGQDQQQPPPAKAVERLNSALQQQLNLDSVKTRAISLFKAISRILEELDAIARANATPKWQDVLGQFSMVNLELYNIVEDIKNVSKAFVVHPKNVNAENATILPVMLSSKLLPEMEMEDNTKREQLLHGMQGLPVVAQIDKLKTRIDMIGAACESAEKIIADARKTYFGTRQGTNLLPTIDKVQAAKIQEQENLLRSAVNHGEGLRVPGDQRQVASSLPMHLVDVLATNDNPQTFQDSSGLYQKSTPPLM...

XP_057769571.1
MWEIEKGKAVLPVMLSSKLLPEMEMEDNTKREQLLHGMQGLPVVAQIDKLKTRIDMIGAACESAEKIIADARKTYFGTRQGTNLLPTIDKVQAAKIQEQENLLRSAVNHGEGLRVPGDQRQVASSLPMHLVDVLATNDNPQTFQDSSGLYQKSTPPLMSTATNNSQGSLLQASGAQLIGRPAASPSGPTTSFDNSTAASPMQYANSPRSGANIMNTPSPQQQQSQQQQLQQQRQKMLQQQLLSQQQLRPSSMPVLGQNQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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