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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002854`

染色体: Chr06 坐标: 41305916-41307699 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002854`
名称	SmilChr06G002854
描述	ethylene-responsive transcription factor ERN1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41305916 - 41307699 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989600`
GeneID	`130989600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989600`
原始查询	`LOC130989600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ethylene-responsive transcription factor ERN1-like
产物	ethylene-responsive transcription factor ERN1-like
Arabidopsis	`AT5G19790` (RAP2.11) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832099] identity=73.5; qcov=0.211; evalue=1.15e-32; confidence=weak
Rice	`Os12g0582900` (OsERF#004) - identity=36.5; qcov=0.883; evalue=8.47e-59; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769576.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769576.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769576.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769576.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41306083`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	73	A1,A10,A11,A15,A4,A5,A7,B104,B110,B112,B113,B125,B126,B127,B130,B135,B139,B140,B23,B24,B30,B33,B37,B38,B39,B44,B45,B49,B51,B53,B56,B58,B61,B62,B63,B64,B68,B76,B79,B80,B82,B87,B9,B91,B96,C12,C14,C18,C19,C22,C24,C27,C29,C32,C35,C38,C41,C44,C47,C48,C55,C6,C60,C68,C70,C77,C78,C8,C82,D3,D4,D8,D9
`Chr6:41306107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:41306201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C15,C25
`Chr6:41306207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr6:41306419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C47,C7
`Chr6:41306458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr6:41306540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B13,C87
`Chr6:41306551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C47,C7,C82
`Chr6:41306552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B30,C15,C25
`Chr6:41306575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr6:41306638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr6:41306662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769576.1

394 aa

197

394

AP2

PF00847 AP2 69-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769576.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	69	118	1.7e-15	57.8	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913593.1
TCTCTAAAAAACTAACAAAACTGTAGCAATAAAAAAAATGAAAAAAATAAGAAAAAACTTAGACCATTTCAACTCTACAGTCTCTCATATTTTGCATATAAAACCAACCATTTCTCACATCAAATGACAAAAATCACTAAACTCTCACACTCCAAAATCAACTACTCCAAAAAGAAACAAATGGCAAGAAAGAGAAAGGCTTGTGATTTTGTAGATGATGAAGAAAAACTCAACCCCAGAGAGAAAAACCTATCGCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989600
ATGACAAAAATCACTAAACTCTCACACTCCAAAATCAACTACTCCAAAAAGAAACAAATGGCAAGAAAGAGAAAGGCTTGTGATTTTGTAGATGATGAAGAAAAACTCAACCCCAGAGAGAAAAACCTATCGCCCAAGTGGGACGAGATGGTGAAGGAGGCAGCCGCCGCGGCGGCGGTGGGCGGCATCAGGCGGGCCCGCAAGCGGTTCGTGGGAGTCCGCCAACGCCCCTCGGGGCGCTGGGTGGCGGAGATAAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769576.1
MTKITKLSHSKINYSKKKQMARKRKACDFVDDEEKLNPREKNLSPKWDEMVKEAAAAAAVGGIRRARKRFVGVRQRPSGRWVAEIKDTIQKIRVWLGTFDTAEEAARAYDEAACLLRGANTRTNFWPTNSNSSSTPALSSKITNLLLSRIKARNSALITANYITTLHPSSSVSLTPPVSQEHAATGDTGEIPDFSESSFTDFLNDPDENYTIENNMIDHKYSSFDSFATQADEKSDETEVDDEMMVMMEPVDFQFVDEIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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