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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002861`

染色体: Chr06 坐标: 41452298-41453632 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002861`
名称	SmilChr06G002861
描述	early nodulin-like protein 19
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41452298 - 41453632 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989606`
GeneID	`130989606`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989606`
原始查询	`LOC130989606`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	early nodulin-like protein 19
产物	early nodulin-like protein 19
Arabidopsis	`AT2G27035` (ENODL20) early nodulin-like protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745563] identity=40.7; qcov=0.819; evalue=7.96e-33; confidence=medium
Rice	`Os07g0112700` (OsENODL19) - identity=40.2; qcov=0.548; evalue=7.86e-21; confidence=medium
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009055 (electron transfer activity)
KEGG	-
Pfam	PF02298 (Cu_bind_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989606

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769602.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769602.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769602.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769602.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41452586`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C22
`Chr6:41452586`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C22
`Chr6:41452587`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C22
`Chr6:41452587`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C22
`Chr6:41452643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:41452685`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	99	A1,A13,A2,A21,A22,A5,A7,A8,A9,B1,B106,B108,B111,B118,B121,B122,B124,B125,B128,B129,B13,B131,B135,B136,B137,B139,B140,B17,B18,B19,B24,B25,B26,B28,B31,B36,B38,B39,B42,B43,B48,B5,B52,B54,B55,B6,B65,B67,B69,B71,B72,B74,B75,B76,B77,B85,B86,B9,B90,B95,C10,C11,C15,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C23,C24,C27,C28,C3,C31,C33,C38,C45,C46,C50,C52,C56,C61,C62,C67,C69,C7,C71,C72,C74,C78,C79,C83,C87,D1,D2,D4,D5,D6
`Chr6:41452689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr6:41452782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:41452810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B3,B70,C62
`Chr6:41452838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:41452888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B89
`Chr6:41453430`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769602.1

177 aa

177

Cu_bind_like

PF02298 Cu_bind_like 38-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769602.1`	Pfam	`PF02298`	Cu_bind_like	Domain	38	123	4.4e-16	59.4	Plastocyanin-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913619.1
CAACATAAACACTCTCATCACACATCTATAAATCAAGAAATGCATGATCACGGCGGCGGCATTCGGTGTTTCCCCGCGGCGGCGGTGTTGGCGGCCGCGATGCTAACATGCGCGGCCGGCGATCTCATCAAGGTCGGCGACAAGGCCGGCTGGACGCCCGACGTGAACTACACTCATTGGGCCGCTCATCGCCACTTCTTCGTCGGAGACTGGCTCTATTTTGTGTTTGATAAGCGGGACACTTCAATATACTACAACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989606
ATGCATGATCACGGCGGCGGCATTCGGTGTTTCCCCGCGGCGGCGGTGTTGGCGGCCGCGATGCTAACATGCGCGGCCGGCGATCTCATCAAGGTCGGCGACAAGGCCGGCTGGACGCCCGACGTGAACTACACTCATTGGGCCGCTCATCGCCACTTCTTCGTCGGAGACTGGCTCTATTTTGTGTTTGATAAGCGGGACACTTCAATATACTACAACGTGTTGGAGGTGAAGAAAGCAAATTACGAGCGGTGCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769602.1
MHDHGGGIRCFPAAAVLAAAMLTCAAGDLIKVGDKAGWTPDVNYTHWAAHRHFFVGDWLYFVFDKRDTSIYYNVLEVKKANYERCDDGEFMKNVTRGGRDVYNLTEARSYYFLSSGGYCFHGMKLSIHVCRSLPPPSPSPSPDVKSAKGGASPESGRDWVAALFMAVLLSIFILRLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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