当前解析结果
SmilChr01G003058| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003058 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003058 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003058 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 49480015 - 49481680 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130989634 |
|---|---|
| GeneID | 130989634 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989634 |
| 原始查询 | LOC130989634 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ATP-dependent RNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829124]; symbol=AT4G30010; hit=AT4G30010; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | ATP-dependent RNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829124]; symbol=AT4G30010; hit=AT4G30010; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G30010 (AT4G30010)ATP-dependent RNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829124] identity=56.1; qcov=0.953; evalue=1.56e-31; confidence=medium |
| Rice | Os02g0175800 (OJ1077_E05.15-1)- identity=56.2; qcov=0.93; evalue=1.13e-28; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989634 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057769649.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057769649.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057769649.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057769649.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057769649.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:49480118 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:49480148 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr1:49480226 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B8,C57 |
Chr1:49480277 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B51,C20,C44,C55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。