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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002888`

染色体: Chr06 坐标: 41737807-41740528 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002888`
名称	SmilChr06G002888
描述	uncharacterized SmilChr06G002888
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41737807 - 41740528 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989636`
GeneID	`130989636`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989636`
原始查询	`LOC130989636`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821278]; symbol=AT3G01060; hit=AT3G01060; species=arabidopsis; confidence=high
产物	lysine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821278]; symbol=AT3G01060; hit=AT3G01060; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G01060` (AT3G01060) lysine-tRNA ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821278] identity=76.9; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0512200` - identity=84.9; qcov=0.875; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14234 (DUF4336)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989636

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769647.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057769647.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057769647.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057769647.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41738022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:41738108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B1,B13
`Chr6:41738841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B127,B61,B68,C12
`Chr6:41738871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B32,C80
`Chr6:41738943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C8
`Chr6:41739069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C8
`Chr6:41739149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:41739281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B47,C8
`Chr6:41739314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B78,C2,C32,C68
`Chr6:41739424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,D11
`Chr6:41739520`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr6:41739547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769647.1

440 aa

220

440

DUF4336

PF14234 DUF4336 90-313 aa PF14234 DUF4336 317-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769647.1`	Pfam	`PF14234`	DUF4336	Family	90	313	1e-106	357.5	Domain of unknown function (DUF4336)
`XP_057769647.1`	Pfam	`PF14234`	DUF4336	Family	317	383	1e-106	357.5	Domain of unknown function (DUF4336)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913664.1
AAAAGAATTCCAACTAGGATATCCCGCCACGTGTCGAAAACTGAACCTCTTCTGGTCCTAAAATCCACCCCTGCAATTGTAATCCTTTTTCACGGTGGTCGAGTGAGCTTCTTCAACTACTTCGTTGTCGGAATTAAGAAATGGCGGCGGCGGCTTTTGCTGTTCCGATACCGAAATCTTCTCAATTGGCTTCTCGAGAACTCAATACTGCCTTTCTCAGTTGCTCGCCGTTGAAGGCCCTCTGTTTTCACCCCAAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989636
ATGGCGGCGGCGGCTTTTGCTGTTCCGATACCGAAATCTTCTCAATTGGCTTCTCGAGAACTCAATACTGCCTTTCTCAGTTGCTCGCCGTTGAAGGCCCTCTGTTTTCACCCCAAATTCAGAAGAAGCAAAGAACTCAGTTTGGTGGTGGCCGCCGCCGCCGCAGACAGCGGCGGAGGTGGAGGAAGGTTTTACTTCAACTTTACTGGGTTCCCATTCCCCCTCGGCCCTTTTCTCAACCGCCAAACTTTGAGATACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769647.1
MAAAAFAVPIPKSSQLASRELNTAFLSCSPLKALCFHPKFRRSKELSLVVAAAAADSGGGGGRFYFNFTGFPFPLGPFLNRQTLRYEAVKDAIWLFEQEQALGFSSVSTNIRMTVIKLKSGGLWVHAPIAPTKECIQLVKELGAPVEYIVLPTFAYEHKIFVGPFSRQFPRAQVWVAPRQWSWPLNLPLEFFGIFRARILEDEDLSTPWADEIEQKVLSSPEVGIGPYVEVAFYHKRTRTLLVTDAVIYVPRQPPECISK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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