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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002901`

染色体: Chr06 坐标: 41823419-41825587 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002901`
名称	SmilChr06G002901
描述	zinc finger protein ZAT2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	41823419 - 41825587 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989640`
GeneID	`130989640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989640`
原始查询	`LOC130989640`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger protein ZAT2
产物	zinc finger protein ZAT2
Arabidopsis	`AT1G26610` (AT1G26610) C2H2-like zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839201] identity=32.4; qcov=0.611; evalue=1.02e-18; confidence=low
Rice	`Os07g0598800` - identity=31.7; qcov=0.344; evalue=1.18e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13912 (zf-C2H2_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769654.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769654.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769654.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769654.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769654.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:41823696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C2,C32,C68,C9
`Chr6:41823787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A1,B120,B128,B135,B46,B5,B59,B87,C39,C80,D3,D9
`Chr6:41823881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B44
`Chr6:41823965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B117
`Chr6:41823973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B24,B66,C36,C48
`Chr6:41824017`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	97	A1,A11,A16,A18,A19,A20,A4,A5,B105,B107,B11,B117,B12,B120,B121,B122,B123,B128,B130,B133,B135,B137,B138,B14,B18,B19,B21,B24,B3,B31,B32,B40,B41,B46,B47,B49,B5,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B64,B66,B69,B70,B72,B76,B79,B8,B84,B85,B87,B89,B9,B90,B92,C11,C13,C23,C24,C26,C28,C3,C36,C37,C39,C40,C45,C46,C48,C5,C50,C54,C6,C61,C64,C66,C67,C69,C70,C71,C76,C78,C80,C82,C83,C84,C86,C9,D1,D3,D8,D9
`Chr6:41824077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B117
`Chr6:41824133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C36
`Chr6:41824155`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A20,B51,C24,C71,C83,C86
`Chr6:41824163`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	66	A1,A13,A16,A18,A20,A9,B105,B117,B12,B121,B122,B123,B128,B129,B133,B135,B137,B14,B19,B31,B40,B41,B49,B5,B51,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B72,B76,B79,B87,B89,B9,B90,B92,C11,C23,C24,C26,C28,C3,C39,C45,C46,C50,C6,C61,C64,C66,C67,C69,C70,C71,C76,C78,C82,C84,C86,C9,D1,D3,D9
`Chr6:41824177`	`C`	`CCG`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A20,B51,C24,C71,C83,C84,C86
`Chr6:41824221`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B24,C36,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769654.1

404 aa

202

404

zf-C2H2_6

PF13912 zf-C2H2_6 8-33 aa PF13912 zf-C2H2_6 115-137 aa PF13912 zf-C2H2_6 143-168 aa PF13912 zf-C2H2_6 333-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769654.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	8	33	9.3e-28	96.3	C2H2-type zinc finger
`XP_057769654.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	115	137	9.3e-28	96.3	C2H2-type zinc finger
`XP_057769654.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	143	168	9.3e-28	96.3	C2H2-type zinc finger
`XP_057769654.1`	Pfam	`PF13912`	zf-C2H2_6	Domain	333	356	9.3e-28	96.3	C2H2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913671.1
TCTTTCTCCCCCTCAAATAGGATGATAACATTTCAACTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTAAACCTAGAATAGTTGTTTGTGATGAGAGAATTGGAGAGTGATTAAGTAATAGAGGTTAAACCCATTTCCCCACCACCTGGCTGGCGTGTACACAACGCCTAATCAAATCAAGCCCCTTTTTTGAAGATTTTAAGGTGATCGTGAAAGTATGGCTGCTCCTCGTGCCCTGTCTTTGCTTCCATGCAAGGCTTCCTTCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989640
ATGGGGGAAGTTGAAGAGCAGAGATACGTGTGCAGAATCTGCAGCAAAGCCTGCGTTAGTGGGAAGTCATTGGGAGGTCACATGAGGGTTCATTTAGCCCAAATTGCAGCTTCCAAGAAGGCAGCTGAGATCAAAATGGAAGATTATGATGATGATGATGATCGTCAGCTCAAAGACAGCTGCATCAACCAATCCAACAGTAGCGAGGAGGAGGAGAAGACTATGAATGCGGAAGCCGGAGAGGGTGATCAGAGCAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769654.1
MGEVEEQRYVCRICSKACVSGKSLGGHMRVHLAQIAASKKAAEIKMEDYDDDDDRQLKDSCINQSNSSEEEEKTMNAEAGEGDQSNNSYELRENPKKSWRISDPKRALSKTTNSCRECGRKFGSLRALSGHMRCHSSKNKKEVHCCKECGRGFESVRAMFGHMKSHSKRVMKVCDSVVESGESLSDMENFCPIRRKRSRIRYKGTVNPSSRCGASEVEEAEEAARCLVMLSRGMVGVGNAGDSDDDSAYFGGVVASCGSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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