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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002915`

染色体: Chr06 坐标: 42008142-42010432 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002915`
名称	SmilChr06G002915
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 52 A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42008142 - 42010432 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989651`
GeneID	`130989651`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989651`
原始查询	`LOC130989651`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 52 A-like
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 52 A-like
Arabidopsis	`AT1G71270` (POK) Vps52 / Sac2 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843468] identity=78.3; qcov=0.843; evalue=2.83e-88; confidence=high
Rice	`Os03g0417900` (OSJNBb0028K20.3) - identity=75.6; qcov=0.812; evalue=1.36e-81; confidence=high
GO	GO:0000938 (GARP complex); GO:0006896 (Golgi to vacuole transport); GO:0019905 (syntaxin binding); GO:0032456 (endocytic recycling); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi)
KEGG	-
Pfam	PF20655 (Vps52_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989651

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769675.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057769675.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057769675.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769675.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769675.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42008955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	51	A10,A2,A4,A6,A8,A9,B105,B119,B120,B121,B122,B137,B139,B14,B15,B33,B36,B39,B5,B52,B57,B59,B6,B61,B63,B64,B74,B75,B79,B85,B9,B91,C10,C14,C16,C19,C28,C35,C36,C4,C47,C5,C54,C55,C67,C72,C75,C77,C81,C82,D6
`Chr6:42009094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr6:42009104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A11,A16,A24,A3,A7,B102,B108,B109,B11,B115,B13,B131,B139,B15,B2,B20,B27,B34,B35,B4,B40,B46,B50,B57,B62,B66,B68,B69,B73,B76,B80,B82,B86,B91,B94,B98,C11,C3,C31,C34,C42,C47,C51,C54,C57,C58,C69,C7,C79,C82,D4,D7
`Chr6:42009159`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B110,B127,B61,B68,C12,C36,C41
`Chr6:42009161`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A23,B100,B101,B114,B115,B124,B29,B37,B38,B39,B42,B43,B97,B98,C2,C32,C34,C46,C59,C68,C73,C81
`Chr6:42009164`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A23
`Chr6:42009164`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A23
`Chr6:42009195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:42009501`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A5,B112,B118,B138,B16,B40,B49,B5,B67,B99,C1,C26,C35,C43,C44,C45,C53,C63,C64,C66,C70,C78,C80,D5
`Chr6:42009864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:42010094`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A19,B18,B46,B61,B64,B72,B8,C37,C39,C51,C70,C77,C80,D8
`Chr6:42010156`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B26,B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769675.1

197 aa

197

Vps52_C

PF20655 Vps52_C 34-76 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769675.1`	Pfam	`PF20655`	Vps52_C	Repeat	34	76	2.5e-09	37.7	Vps52, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913692.1
ATTGTTTTATCTTTCTTCATCTGCCTGGTTTTGTGTGTATACCCTGCTAGCAGATGGGTTTCTGGGGTGTAAATCTGTGTTTTCTTCCAGTTATCATATATTATTCAGCGTAGCCCTCTTTTTGCTGCTCGCAAAGCAGGTATGGGTTTTGTGTTGACTGTTGAGTGAATACCTTGGACCTTTTTAAAGAAAATTGTAACTCATTTATGGATAGTGGGCTCTATTGAGTTAGAGTGGAATGGTGATTGAAGTAGGAGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989651
ATGTGGATTATGGAGATGGTCAGCTACAACTCAACTTGGAAAGACTGCGAATGTCAGTGGACGATTTGCTTGTCAAGCTTGCCAAATTGTTCCAGAAACCAAAGTCTCAGACTGTTTTTGATAAATAACTACGACATGACAATTGCTGTACTGAAGGAAGCTGGTCCTGATGGTGGAAAAATTCAAATGCACTTTGAAGAGTTTCTGAAGAGCAATACGGCCATTTATGTGGAGGAACTACTTGCAGAACACTTCCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769675.1
MWIMEMVSYNSTWKDCECQWTICLSSLPNCSRNQSLRLFLINNYDMTIAVLKEAGPDGGKIQMHFEEFLKSNTAIYVEELLAEHFHDLIKFVKTRASEDPCSGSERPITVSEVESIVKDFGSRWKAAIELMHNDVSTSFSNFLCGMEILRAALTQLLLYYTRLSDCMKKIAGGSALNKDLVSISSIMYEIRKYSRTF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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