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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002917`

染色体: Chr06 坐标: 42013550-42018128 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002917`
名称	SmilChr06G002917
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42013550 - 42018128 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989657`
GeneID	`130989657`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989657`
原始查询	`LOC130989657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10-like
产物	ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10-like
Arabidopsis	`AT4G10570` (UBP9) ubiquitin-specific protease 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826649] identity=59.6; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0160000` - identity=54.3; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004843 (cysteine-type deubiquitinase activity); GO:0016579 (protein deubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00443 (UCH); PF13423 (UCH_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989657

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769683.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057769683.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769683.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057769683.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769683.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42014009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:42014014`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B135,B25,B92,C57,C70,D9
`Chr6:42014387`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	28	A11,A24,A3,B102,B108,B11,B13,B131,B20,B27,B4,B46,B57,B69,B73,B76,B86,B91,B94,B98,C31,C42,C57,C69,C79,C8,C82,D7
`Chr6:42014396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr6:42014442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:42014455`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	28	A14,A19,A24,A6,B103,B112,B122,B123,B134,B17,B41,B44,B75,B81,B86,B89,B93,B95,C10,C14,C23,C25,C40,C56,C74,C87,D11,D3
`Chr6:42014686`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A10,A21,A6,B10,B118,B134,B23,B28,B45,B47,B53,B62,B72,B78,B99,C22,C37,C58,C60,C72,C77,D5
`Chr6:42014687`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	49	A10,A15,A4,A6,A8,B101,B103,B104,B106,B112,B118,B120,B126,B129,B134,B140,B16,B17,B40,B41,B44,B49,B67,B75,B8,B81,B86,B93,B99,C14,C20,C23,C25,C40,C41,C43,C44,C53,C56,C74,C78,C81,C85,D10,D11,D2,D3,D5,D7
`Chr6:42014695`	`T`	`TGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A10,A21,A6,B10,B118,B134,B14,B23,B28,B33,B45,B47,B53,B62,B72,B78,B99,C22,C37,C58,C60,C72,C77,C86,D5
`Chr6:42014747`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B26,B35,B47,D1
`Chr6:42014747`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B26,B35,B47,D1
`Chr6:42014758`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769683.1

647 aa

324

647

UCH_1

UCH

PF13423 UCH_1 71-250 aa PF00443 UCH 71-619 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769683.1`	Pfam	`PF13423`	UCH_1	Domain	71	250	7.1e-12	46.3	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase
`XP_057769683.1`	Pfam	`PF00443`	UCH	Family	71	619	2.4e-60	205.0	Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913700.1
GTGCGGTATGGAAATTCTGAGAGCTGCTTTGACTCAATTGCTGCTTTACTACACCAGGCTTTCAGATTGCATGAAGAAAATTGCTGGTGGGTCTGCATTGAACAAGGATTTGGTTTCCATATCTTCAATAATGTACTTCTTGAGGTGCCAAGTGATGGTTTTGGCATGGATTCAACTGGGAATGGCTTAGCATTGGTTCCAGTGGAACCTTCAAGGTCAATCTTTTCAATTGCTGGTGGTCCAACTATGTGTAATGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989657
ATGGATTCAACTGGGAATGGCTTAGCATTGGTTCCAGTGGAACCTTCAAGGTCAATCTTTTCAATTGCTGGTGGTCCAACTATGTGTAATGGGAATTCAATTGGTTATAACCCCATTTACCAGCGAAGTACATCTACTTCTACATATGGAGATATGGAAGATGGATTTGAGGGTTTGAAGCCTGCAACAAGAGGAGATAGGGGTGGCTTGGCTGGATTGCAGAATTTGGGGAACACTTGCTTCATGAACAGTTCGCTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769683.1
MDSTGNGLALVPVEPSRSIFSIAGGPTMCNGNSIGYNPIYQRSTSTSTYGDMEDGFEGLKPATRGDRGGLAGLQNLGNTCFMNSSLQCLVHTPPLADYFLQDYSDEINRQNPLRMHGELTLAFGELLRKLWSPGRAPVAPRAFKGKLARFAPQFSGYNQHDSQELLAFLLDGLHEDLNRVKQKPYIEIKDSDGRPDEDVADELWRYLKARNDSVIVDICQGQYKSTLVCPVCDKISITFDPFMYLSLPLPSTATRLMTVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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