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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002937`

染色体: Chr06 坐标: 42199986-42200769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002937`
名称	SmilChr06G002937
描述	protein CHLORORESPIRATORY REDUCTION 7, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42199986 - 42200769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989677`
GeneID	`130989677`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989677`
原始查询	`LOC130989677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHLORORESPIRATORY REDUCTION 7, chloroplastic
产物	protein CHLORORESPIRATORY REDUCTION 7%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G39210` (CRR7) chlororespiratory reduction 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833917] identity=67.4; qcov=0.503; evalue=4.84e-41; confidence=medium
Rice	`Os01g0763700` (P0403C05.1-2) - identity=71.3; qcov=0.55; evalue=4.92e-40; confidence=medium
GO	GO:0009570 (chloroplast stroma)
KEGG	-
Pfam	PF12095 (CRR7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989677

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769709.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057769709.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769709.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769709.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42200183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:42200280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:42200333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D6
`Chr6:42200333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr6:42200360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:42200687`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B19,B55,C23,C54
`Chr6:42200687`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B19,B55,C23,C54
`Chr6:42200693`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A16,B7,B74,B79,C8,D10
`Chr6:42200698`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	93	A1,A13,A25,A5,A8,A9,B102,B108,B111,B113,B115,B117,B121,B122,B123,B124,B128,B129,B132,B133,B135,B136,B137,B138,B15,B17,B18,B24,B29,B31,B33,B36,B4,B42,B43,B5,B53,B54,B57,B59,B6,B61,B62,B63,B67,B73,B74,B75,B77,B78,B83,B85,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B99,C1,C11,C14,C17,C26,C27,C31,C43,C44,C46,C47,C5,C50,C53,C58,C61,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C76,C79,C82,C84,C9,D10,D11,D4
`Chr6:42200707`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	79	A11,A14,A16,A18,A19,A2,A22,A24,A3,A4,A6,A7,B101,B103,B105,B112,B118,B12,B13,B131,B134,B14,B140,B16,B19,B22,B25,B28,B34,B37,B41,B44,B45,B46,B47,B49,B52,B55,B56,B58,B64,B66,B72,B76,B80,B84,B94,B96,B97,C16,C2,C20,C21,C23,C28,C29,C30,C32,C33,C48,C49,C52,C54,C55,C57,C59,C60,C65,C68,C73,C75,C78,C85,D1,D2,D3,D7,D8,D9
`Chr6:42200718`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A16,A3
`Chr6:42200718`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A16,A3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769709.1

171 aa

171

CRR7

PF12095 CRR7 93-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769709.1`	Pfam	`PF12095`	CRR7	Family	93	171	5.8e-29	101.0	Protein CHLORORESPIRATORY REDUCTION 7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913726.1
ATGATGATAAGTCTTTGGGATGAAAGTAAGGTTAATATTTGGTATCATCTTATCCTTTTTTTCTCTTCACAGAGTTGTCGTGAATTAATGGCGAAAATAATATTGAGCACCAAAATTCATCCCCATTTCCCTGCAACATTCTCCCAATCCAAAACACCAGCAATTCTCACAACCCCAACTCCATTTCTCCACAAATGGGTTCATCATCAAAACACCCAATTCCGAGGTCATCAACTCAAGGTTAATGGCGTGAGGAGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989677
ATGATGATAAGTCTTTGGGATGAAAGTAAGGTTAATATTTGGTATCATCTTATCCTTTTTTTCTCTTCACAGAGTTGTCGTGAATTAATGGCGAAAATAATATTGAGCACCAAAATTCATCCCCATTTCCCTGCAACATTCTCCCAATCCAAAACACCAGCAATTCTCACAACCCCAACTCCATTTCTCCACAAATGGGTTCATCATCAAAACACCCAATTCCGAGGTCATCAACTCAAGGTTAATGGCGTGAGGAGGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769709.1
MMISLWDESKVNIWYHLILFFSSQSCRELMAKIILSTKIHPHFPATFSQSKTPAILTTPTPFLHKWVHHQNTQFRGHQLKVNGVRRRRRSNTETETYVLMEPGESEEFVSEDELRERLKGWLQRWPGKSLPPDLARFDSIDDAVQYLVKSVCELEIDGDVGSLQWYQVRLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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