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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr06G002950

染色体: Chr06 坐标: 42306318-42310753 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr06G002950
名称SmilChr06G002950
描述uncharacterized SmilChr06G002950
染色体 / SeqIDChr06 / NC_080392.1
坐标与链方向42306318 - 42310753 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130989689
GeneID130989689
locus_tag-
NCBI NameLOC130989689
原始查询LOC130989689

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822663]; symbol=AT3G29760; hit=AT3G29760; species=arabidopsis; confidence=medium
产物Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822663]; symbol=AT3G29760; hit=AT3G29760; species=arabidopsis; confidence=medium
ArabidopsisAT3G29760 (AT3G29760)
Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822663]
identity=56.65; qcov=0.457; evalue=1.52e-83; confidence=medium
RiceOs07g0109300
-
identity=56.91; qcov=0.421; evalue=1.75e-75; confidence=low
GOGO:0004721 (phosphoprotein phosphatase activity)
KEGG-
PfamPF03031 (NIF)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130989689

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank定位位置中文五折投票比例Protein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057769732.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr6:42306622 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C14
Chr6:42306637 G GA 1bp_insertion frameshift_variant 1 B91
Chr6:42306637 G GA 1bp_insertion CDS_variant 1 B91
Chr6:42306639 AGT A 2bp_deletion frameshift_variant 32 A2,A7,B10,B101,B11,B12,B137,B140,B19,B35,B40,B42,B43,B49,B55,B70,B72,B75,B78,C10,C14,C23,C45,C47,C5,C53,C54,C60,D1,D10,D11,D5
Chr6:42306798 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B52
Chr6:42306807 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D1
Chr6:42307583 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D1
Chr6:42307610 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B107,B80,C12,C35
Chr6:42308670 AT A 1bp_deletion frameshift_variant 1 C40
Chr6:42308670 AT A 1bp_deletion CDS_variant 1 C40
Chr6:42308761 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C62
Chr6:42308913 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 B19,B60,C13,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769732.1
444 aa
N
1
222
444
NIF
C
PF03031 NIF 216-399 aa
XP_057769733.1
444 aa
N
1
222
444
NIF
C
PF03031 NIF 216-399 aa
XP_057769735.1
444 aa
N
1
222
444
NIF
C
PF03031 NIF 216-399 aa
XP_057769736.1
444 aa
N
1
222
444
NIF
C
PF03031 NIF 216-399 aa
XP_057769737.1
444 aa
N
1
222
444
NIF
C
PF03031 NIF 216-399 aa
XP_057769738.1
368 aa
N
1
184
368
NIF
C
PF03031 NIF 216-360 aa
XP_057769739.1
368 aa
N
1
184
368
NIF
C
PF03031 NIF 216-360 aa
XP_057769740.1
368 aa
N
1
184
368
NIF
C
PF03031 NIF 216-360 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057769732.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 399 3.2e-18 66.6 NLI interacting factor-like phosphatase
XP_057769733.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 399 3.2e-18 66.6 NLI interacting factor-like phosphatase
XP_057769735.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 399 3.2e-18 66.6 NLI interacting factor-like phosphatase
XP_057769736.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 399 3.2e-18 66.6 NLI interacting factor-like phosphatase
XP_057769737.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 399 3.2e-18 66.6 NLI interacting factor-like phosphatase
XP_057769738.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 360 4e-14 53.3 NLI interacting factor-like phosphatase
XP_057769739.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 360 4e-14 53.3 NLI interacting factor-like phosphatase
XP_057769740.1 Pfam PF03031 NIF Family 216 360 4e-14 53.3 NLI interacting factor-like phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

8 records

下载 cDNA FASTA
XM_057913749.1
TATATATTTACAGTTGCTAATATCATAAATCGCAGTTAGGTGCAGTGCGAATTACGCAAAAGCCTAAATAGTGAATTTAATGTGAGATTGGGATCGACGGCTCTCTGCTTAAGTCTACACTAAATCAACGGTTAAGCACTTTGGCATCTGCTCGTCTTCTTCAATGGAAACTTCATCGTCAGTTTATGATTCAGGTTAGTCTGTGAAGTGTGAGATGCAAAATAATTCAATTAGCACAAGAGAGAAACTGGATGTATTTC...
XM_057913757.1
TATATTTACAGTTGCTAATATCATAAATCGCAGTTAGGTGCAGTGCGAATTACGCAAAAGCCTAAATAGTGAATTTAATGTGAGATTGGGATCGACGGCTCTCTGCTTAAGTCTACACTAAATCAACGGTTAAGCACTTTGGCATCTGCTCGTCTTCTTCAATGGAAACTTCATCGTCAGTTTATGATTCAGGTTGCACAAGGAATTACTGCACAATTAGCTGGAGATAGTTCAACTTGCCATTAAAAGAGAGACAGACA...

CDS

8 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080392.1_cds_XP_057769732.1_33834
ATGGAGAAAATTGAAGGCCAGATAGATGGTACGTTGGAAGCTTCCAGTGATATAATGGATACTGATGTTGAAAAGGATCTTCTTGAAGCAGATTTAACAGTGGAATCACTGGCAGAAAACCTTAAAGCATCTGCAGGGCCAACAGAGAACATCCCTGAGGAGATCGCAGACAGCGAACACAAAAGGAAAGAAAATTTGAAGAAGGCAAAGGCTGCAGGTGAAATTCGAAATGTGGACCAGGCTAATATTGATATAGGGTC...
lcl|NC_080392.1_cds_XP_057769733.1_33835
ATGGAGAAAATTGAAGGCCAGATAGATGGTACGTTGGAAGCTTCCAGTGATATAATGGATACTGATGTTGAAAAGGATCTTCTTGAAGCAGATTTAACAGTGGAATCACTGGCAGAAAACCTTAAAGCATCTGCAGGGCCAACAGAGAACATCCCTGAGGAGATCGCAGACAGCGAACACAAAAGGAAAGAAAATTTGAAGAAGGCAAAGGCTGCAGGTGAAATTCGAAATGTGGACCAGGCTAATATTGATATAGGGTC...

Protein

8 records

下载 Protein FASTA
XP_057769732.1
MEKIEGQIDGTLEASSDIMDTDVEKDLLEADLTVESLAENLKASAGPTENIPEEIADSEHKRKENLKKAKAAGEIRNVDQANIDIGSIESIAEGNPNGKRKRGSILRYETKIMNQATGSSNFHSSESRITENECPAKDFEISVRKESSLSVSVHEVSDENITNNGQCSAEGGSIFSTCNVEGTSHLSSPNVNEAECLSKDLGYNTRITPMPSIVRKLIVLDVNGLLANIVMPAPKDYRADEHILGRAIFKRPFCDDFLKF...
XP_057769733.1
MEKIEGQIDGTLEASSDIMDTDVEKDLLEADLTVESLAENLKASAGPTENIPEEIADSEHKRKENLKKAKAAGEIRNVDQANIDIGSIESIAEGNPNGKRKRGSILRYETKIMNQATGSSNFHSSESRITENECPAKDFEISVRKESSLSVSVHEVSDENITNNGQCSAEGGSIFSTCNVEGTSHLSSPNVNEAECLSKDLGYNTRITPMPSIVRKLIVLDVNGLLANIVMPAPKDYRADEHILGRAIFKRPFCDDFLKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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