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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002951`

染色体: Chr06 坐标: 42323158-42324536 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002951`
名称	SmilChr06G002951
描述	leucine-rich repeat protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42323158 - 42324536 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989691`
GeneID	`130989691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989691`
原始查询	`LOC130989691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	leucine-rich repeat protein 1-like
产物	leucine-rich repeat protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G65700` (BAM1) Leucine-rich receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836699] identity=39.6; qcov=0.958; evalue=1.06e-35; confidence=medium
Rice	`Os11g0695800` (MRKc) - identity=42.9; qcov=0.932; evalue=1.09e-34; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769741.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769741.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769741.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769741.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769741.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42323389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B33,B34,B91,C82
`Chr6:42323489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B65
`Chr6:42323569`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B13,B134,B53,B64,C27,C37,C6
`Chr6:42323602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr6:42323658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C33
`Chr6:42323684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C18,C70,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769741.1

190 aa

190

LRRNT_2

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 2-19 aa PF00560 LRR_1 48-69 aa PF00560 LRR_1 72-93 aa PF00560 LRR_1 98-120 aa PF00560 LRR_1 122-143 aa PF00560 LRR_1 147-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769741.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	2	19	5.7e-05	24.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057769741.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	48	69	4e-19	65.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057769741.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	72	93	4e-19	65.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057769741.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	98	120	4e-19	65.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057769741.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	122	143	4e-19	65.3	Leucine Rich Repeat
`XP_057769741.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	147	168	4e-19	65.3	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913758.1
TCTTCCCAATATTATTTCCTTATTCTCCTACTCCTACTTTTCCATTCTTTGCAAAACTCTATATTTGCCATCAACACAGATTTTTCTTCTCTCATTGCCTTGAAATCCCACATAACCTCAGACCCTCACAACATACTGATGAAAAACTGGAGCTCCGAAGCCAGCATGTGTAGCTGGATCGGAGTTACTTGTGATTCACGTCGTAATAGGGTGACTGAGCTAAACATACCGCTCATGGGCCTTGTGGGCACCATACCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989691
ATGAAAAACTGGAGCTCCGAAGCCAGCATGTGTAGCTGGATCGGAGTTACTTGTGATTCACGTCGTAATAGGGTGACTGAGCTAAACATACCGCTCATGGGCCTTGTGGGCACCATACCACCAGAGATCGGAAATCTTTCTTCTCTCGTCTCGTTGAATATGAATGAGAACTCTTTCCATGGCCCCATCCCTCCATCCATCTTCAATATCTCGTCGTTAGAGGTTTTGGAATTACGAAATAACAATTTATCGAGTAGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769741.1
MKNWSSEASMCSWIGVTCDSRRNRVTELNIPLMGLVGTIPPEIGNLSSLVSLNMNENSFHGPIPPSIFNISSLEVLELRNNNLSSSLPSDMCKHSLHKLKRLRISFNELCGDIPLSLGQCSQLEYLSLRSNNFGGQVPTQIGNITLLQFLSFGANNLSGTIPKEIGNLTMLQILDLGDNKLFGKIFISML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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