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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002953`

染色体: Chr06 坐标: 42349181-42352644 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002953`
名称	SmilChr06G002953
描述	putative methylesterase 11, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42349181 - 42352644 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989692`
GeneID	`130989692`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989692`
原始查询	`LOC130989692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative methylesterase 11, chloroplastic
产物	putative methylesterase 11%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G29770` (MES11) methyl esterase 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822677] identity=72.7; qcov=0.934; evalue=1.11e-170; confidence=high
Rice	`Os07g0603600` - identity=64.8; qcov=0.816; evalue=3.57e-150; confidence=high
GO	GO:0080030 (methyl indole-3-acetate esterase activity); GO:0080032 (methyl jasmonate esterase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989692

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057769742.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057769742.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769742.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769742.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769742.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42349435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42349449`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr6:42349449`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42349494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42349616`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A22,A7,A9,B104,B111,B118,B124,B128,B138,B14,B18,B25,B27,B42,B51,B52,B58,B59,B6,B64,B66,B68,B74,B86,B90,B99,C14,C35,C36,C4,C46,C47,C49,C5,C50,C54,C6,C62,C66,C71,D4,D6
`Chr6:42349618`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A22,A7,A9,B104,B111,B118,B124,B128,B138,B14,B18,B25,B27,B42,B51,B52,B58,B59,B6,B64,B66,B68,B74,B86,B90,B99,C14,C35,C36,C4,C46,C47,C49,C5,C50,C54,C6,C62,C66,C71,D4,D6
`Chr6:42349645`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:42349713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr6:42350922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:42350955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr6:42351011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B25,B90,B92,C73,D9
`Chr6:42351036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B80,C12,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769742.1

376 aa

188

376

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 125-362 aa PF12146 Hydrolase_4 127-231 aa PF12697 Abhydrolase_6 127-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769742.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	125	362	1.6e-17	64.8	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057769742.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	127	231	1.7e-10	41.3	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057769742.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	127	365	7e-18	66.8	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913759.1
CTTTCTTTGTATGTGAAAGCTGCTTTCCTTTCCCTCTTTCGTCATCTTCCGCATTCACCGAAGTGCCAATTCCGTTTCCCAATATCTCTCAACCTGCGTATCCAATCCATAGATTCGGTCGCGCGCATATCCGCATAGGTTTCCACGGCGGTATCCATCTACTTGCATGCGATGATGATCCAGTAGGAGCCGCCGTCGAATTCTGAAACGATCCAACTATGGGGATGTGTTTCTCCCGCGGCGACAGATCGCCGCCGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989692
ATGGGGATGTGTTTCTCCCGCGGCGACAGATCGCCGCCGAAGAGGAGAGGCTCCAGGCGAGTCACGAACCCGGCGGCGGACGGCGGCGCCGGGAGCAATCGGTGGGCGAGGATTCGGTCTTCGAGGAAGGAGGAGAACTTGATTCACGAGCGGGCGCTGGCGGCGGCGATTCTGTTCCAGCAGCAGCTGCAGAACGGAGGCGGAACGGCGCCGTTCGATAGGTCGGCGTCGTTGAGGTATCCGAACGGGAATTCCAAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769742.1
MGMCFSRGDRSPPKRRGSRRVTNPAADGGAGSNRWARIRSSRKEENLIHERALAAAILFQQQLQNGGGTAPFDRSASLRYPNGNSKRNQALPRSSSSRARSLTDPLLQPHQLVNQDIKLDNLETNHFVLVHGGGFGAWCWYKTIALLEEGGYKVTAVDLTGSGIHSFDTNNIKSLSQYVKPLTELMEKLNDKEKVILVGHDFGGTCISYAMELFPTKVSKAIFLAAAMLTSGQSALDIFSDKVESNELMRQAQVFLYANG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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