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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002959`

染色体: Chr06 坐标: 42391072-42393776 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002959`
名称	SmilChr06G002959
描述	putative receptor-like protein kinase At5g39000
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42391072 - 42393776 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989698`
GeneID	`130989698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989698`
原始查询	`LOC130989698`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative receptor-like protein kinase At5g39000
产物	putative receptor-like protein kinase At5g39000
Arabidopsis	`AT5G39000` (AT5G39000) Malectin/receptor-like protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833892] identity=39.1; qcov=1.08; evalue=1.35e-161; confidence=medium
Rice	`Os01g0769700` (DRUS2) - identity=37.5; qcov=1.04; evalue=1.12e-141; confidence=medium
GO	GO:0004714 (transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0046777 (protein autophosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769749.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769749.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769749.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769749.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769749.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42391190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B132
`Chr6:42391289`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B62,C3
`Chr6:42391289`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B62,C3
`Chr6:42391352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B93
`Chr6:42391376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C70,D3
`Chr6:42391382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B93,C8
`Chr6:42391384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:42391391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C19,C5
`Chr6:42391395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,B80,C35
`Chr6:42391398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C10,C8
`Chr6:42391429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C61
`Chr6:42391550`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A25,B19,B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769749.1

773 aa

386

773

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 451-723 aa PF00069 Pkinase 453-721 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769749.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	451	723	8.5e-50	170.2	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057769749.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	453	721	1.4e-46	159.8	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913766.1
TTATTTGCTATCAAACTCATCATTCATCTTCCTTAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAACTCATCGTTCATCGTTCTATAATTTCTGTCCCCAAAATCAGAGCATGAATTCGTGTCTGATTTCAGTTGGTTTGCTATTATTTCTCTGCTTCTTCATCACATTCTCATCTTGGAGCAATAATCAAGCTGACTTCACAGGCGATGTTTCAATCAACTGCGGCTCTACTGGAGCTTCTGCAGCGCGCAATGGCGACCAATGGCTCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989698
ATGAATTCGTGTCTGATTTCAGTTGGTTTGCTATTATTTCTCTGCTTCTTCATCACATTCTCATCTTGGAGCAATAATCAAGCTGACTTCACAGGCGATGTTTCAATCAACTGCGGCTCTACTGGAGCTTCTGCAGCGCGCAATGGCGACCAATGGCTCGGAGACGTACGCTCAAAAATCTCTCCACCGCTGCAGTTAAGGGGCTCATCAGCCGCATCAGCTGCCATCAATCAGTTGAGCTCTGCCGATCCAGTTCCGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769749.1
MNSCLISVGLLLFLCFFITFSSWSNNQADFTGDVSINCGSTGASAARNGDQWLGDVRSKISPPLQLRGSSAASAAINQLSSADPVPHKTARISRSQFSYAFQLKAGQKIIRLHFNPTPYRGFKGLRDFFTVEAGPFTLLGNFSASLTAGALRVNTLSKEFCLNIRENQQLIITFTPSRSQDTYAFINGIEIISVPATLSYFDGGDIGLRVIGQNSMVYVDDSTALEIVHWQRIKQDIVQSSGDFDGVFPKWARQRANKVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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