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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002976`

染色体: Chr06 坐标: 42584882-42587499 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002976`
名称	SmilChr06G002976
描述	uncharacterized SmilChr06G002976
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42584882 - 42587499 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989711`
GeneID	`130989711`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989711`
原始查询	`LOC130989711`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.8; qcov=0.699; evalue=4.94e-62; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=28.8; qcov=0.704; evalue=1.85e-61; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989711

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769762.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769762.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769762.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769762.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769762.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42585671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C37,C75
`Chr6:42585771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr6:42585801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,C22
`Chr6:42585828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:42585866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr6:42585907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B60,C22
`Chr6:42585922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:42585960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,C3
`Chr6:42585966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A7,B133,C25,C81
`Chr6:42586041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B27,B59,C39
`Chr6:42586216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B45,B74,B96
`Chr6:42586216`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,B74,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769762.1

838 aa

419

838

Transposase_mut

MULE

SWIM

PF00872 Transposase_mut 396-493 aa PF10551 MULE 397-491 aa PF04434 SWIM 641-669 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769762.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	396	493	1.3e-09	38.2	Transposase, Mutator family
`XP_057769762.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	397	491	8.1e-20	71.7	MULE transposase domain
`XP_057769762.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	641	669	4.3e-09	36.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913779.1
CGGGGCGACGTATTATGATACATCATGGCGGTCGTTGGGAGCGATCAACATATATAGATGGGGAATTCTTTGTTGCGTATATCGATTCCGGTACAATTAATCGTGCTAACCTCGTGGATCTTATTAGAGAGGGTTTGGGATATCGAAATGAGACCGAATATACGTTATGGTACGTCACAAACATCAATGGTATTAAAGCAAAAGTTCTATTGAGGGGAGATATGGAGTTGCTTCGATGGTTAGCAGATCCTAGAGAGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989711
ATGATACATCATGGCGGTCGTTGGGAGCGATCAACATATATAGATGGGGAATTCTTTGTTGCGTATATCGATTCCGGTACAATTAATCGTGCTAACCTCGTGGATCTTATTAGAGAGGGTTTGGGATATCGAAATGAGACCGAATATACGTTATGGTACGTCACAAACATCAATGGTATTAAAGCAAAAGTTCTATTGAGGGGAGATATGGAGTTGCTTCGATGGTTAGCAGATCCTAGAGAGGATCCAGAAGTTTATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769762.1
MIHHGGRWERSTYIDGEFFVAYIDSGTINRANLVDLIREGLGYRNETEYTLWYVTNINGIKAKVLLRGDMELLRWLADPREDPEVYVIEKGGSSGPDSNVSRNTMRGCTSAVHHDQRMPYHEEDDEEVFDEDYEEDEAESTSEDDVEDRRNELRHFSSDYQTASYVEHEHGSRDWDIPFPHIESILQLGWEEYHPIAYGLLEVGAIFRSKVELRIAIGIYHLEHYLEFATDRSTDSRAVYICKSGRKNCTFRLCAVEAAT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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