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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002997`

染色体: Chr06 坐标: 42854166-42858547 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002997`
名称	SmilChr06G002997
描述	amino acid transporter AVT6A
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42854166 - 42858547 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989732`
GeneID	`130989732`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989732`
原始查询	`LOC130989732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	amino acid transporter AVT6A
产物	amino acid transporter AVT6A
Arabidopsis	`AT3G30390` (AT3G30390) Transmembrane amino acid transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822740] identity=70.1; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0633800` (OsATL5) - identity=65.6; qcov=0.987; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003333 (amino acid transmembrane transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans); PF03222 (Trp_Tyr_perm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989732

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057769793.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057769793.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057769793.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769793.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42855213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr6:42855261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B37,B69,B9,C38
`Chr6:42855264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C21,D7
`Chr6:42855492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B77
`Chr6:42855516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,D6
`Chr6:42856805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C21,D7
`Chr6:42856815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:42858071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A7,B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769793.1

462 aa

231

462

Aa_trans

Trp_Tyr_perm

PF01490 Aa_trans 44-447 aa PF03222 Trp_Tyr_perm 45-297 aa

XP_057769794.1

462 aa

231

462

Aa_trans

Trp_Tyr_perm

PF01490 Aa_trans 44-447 aa PF03222 Trp_Tyr_perm 45-297 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769793.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	44	447	2.7e-54	185.2	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057769793.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	45	297	1e-13	51.9	Tryptophan/tyrosine permease family
`XP_057769794.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	44	447	2.7e-54	185.2	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057769794.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	45	297	1e-13	51.9	Tryptophan/tyrosine permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913811.1
GAATTTGCTTGAACATTAAACCAAAAAAAAATCCCTTATAAAAATCTTCACGTGTCTTCATCTTCTTCATTTGGTTTTGTTTAAAACGAAAAATCAATCAGCACACACACCATTCGCGGCCTCTCAAGTTTTTGGAGGTCACCTATTTCTCTCTCGAAACGAAGGGGACCCCCAAAAGCGAAAACATCCATTGAAAGCGACACCTATGGTCGTCGTTTCGGCGGTGGAAATTATTGATCGATATACTGCTCGCAAAAAAA...

XM_057913810.1
TTTTGTTTAAAACGAAAAATCAATCAGCACACACACCATTCGCGGCCTCTCAAGTTTTTGGAGGTCACCTATTTCTCTCTCGAAACGAAGGGGACCCCCAAAAGCGAAAACATCCATTGAAAGCGACACCTATGGTCGTCGTTTCGGCGGTGGAAATTATTGATCGATATACTGCTCGCAAAAAAAAAAAAAATCCAAGGTTTGATTTTTTGTTTCCTCGGAATTATATGTTCAACAGTGAAATTTAATTATTGTTATTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989732
ATGACGATTGGAAGTCTTAAGCCTAGCAAAGCGAAGACATCAAGGAAGAGCAAGCAACCACTCGTTGATGAGAAATCCCCATTACTTCCCACCAAGCATGGGGAAGATAGTTTCGATGAGTTCAATGGGGCTTCTTTCAGCGGGGCGGTGTTTAATTTGTCCACGACAATTGTAGGTGCAGGAATCATGGCTTTGCCTGCCACCATGAAGGTGTTGGGACTTATCCCAGGGGTTGCTGCAATCATCTTTATGGCATTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769793.1
MTIGSLKPSKAKTSRKSKQPLVDEKSPLLPTKHGEDSFDEFNGASFSGAVFNLSTTIVGAGIMALPATMKVLGLIPGVAAIIFMAFLTNASIEFLLRFSRTSKSVSYGGLMEDAFGNWGRILIQLCVLVNNIGVLIVYMIIIGDVLSGTTSDGIHHAGVLEGWFGEQWWTGRFFVLVVTTVAVFAPLASLKRIDSLRYTSALSVALAVIFLVITVGITLYKLIDGTIQMPRLFPEVTNLMSVLNLFTVVPVLVTAYICHY...

XP_057769794.1
MTIGSLKPSKAKTSRKSKQPLVDEKSPLLPTKHGEDSFDEFNGASFSGAVFNLSTTIVGAGIMALPATMKVLGLIPGVAAIIFMAFLTNASIEFLLRFSRTSKSVSYGGLMEDAFGNWGRILIQLCVLVNNIGVLIVYMIIIGDVLSGTTSDGIHHAGVLEGWFGEQWWTGRFFVLVVTTVAVFAPLASLKRIDSLRYTSALSVALAVIFLVITVGITLYKLIDGTIQMPRLFPEVTNLMSVLNLFTVVPVLVTAYICHY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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