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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G002998`

染色体: Chr06 坐标: 42861074-42869499 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G002998`
名称	SmilChr06G002998
描述	uncharacterized SmilChr06G002998
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	42861074 - 42869499 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989733`
GeneID	`130989733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989733`
原始查询	`LOC130989733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kanadaptin; symbol=kanadaptin; hit=Os06g0275900; species=rice; confidence=high
产物	kanadaptin; symbol=kanadaptin; hit=Os06g0275900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G38840` (AT5G38840) SMAD/FHA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833875] identity=50.1; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0275900` (kanadaptin) - identity=58.5; qcov=0.873; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00498 (FHA); PF16697 (Yop-YscD_cpl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769796.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769796.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769796.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769796.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769796.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:42861341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B97,C37,C53,C60
`Chr6:42861534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B5,B62,B71,C3
`Chr6:42861963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr6:42862013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B59,B68
`Chr6:42862925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:42862955`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	136	A13,A14,A15,A18,A19,A20,A24,A5,A7,A8,A9,B1,B101,B103,B108,B109,B110,B111,B112,B123,B125,B13,B132,B135,B136,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B19,B2,B23,B24,B25,B26,B30,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B59,B60,B61,B62,B66,B68,B69,B70,B71,B72,B74,B75,B77,B83,B88,B89,B90,B92,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C20,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C35,C39,C4,C40,C42,C49,C5,C52,C55,C56,C57,C60,C61,C62,C63,C65,C69,C7,C70,C73,C74,C75,C76,C8,C80,C82,C83,C85,C86,C9,D1,D2,D5,D7,D8,D9
`Chr6:42863400`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr6:42867274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:42867275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr6:42867583`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr6:42868443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,C21,D7
`Chr6:42868469`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769796.1

757 aa

378

757

Yop-YscD_cpl

FHA

PF16697 Yop-YscD_cpl 137-209 aa PF00498 FHA 141-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769796.1`	Pfam	`PF16697`	Yop-YscD_cpl	Domain	137	209	1.8e-08	35.4	Inner membrane component of T3SS, cytoplasmic domain
`XP_057769796.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	141	208	2.7e-20	73.3	FHA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913813.1
AGAGAATATGAGATAAAGTTCAATAAGTTTATCAAGTCAATTGTCACCCTCTTTAACTTTCAATTTTGTTATTTTTATACATTTTCAAAATTTTAAACTCGCGAGGAAAGCTAATTGTGATTTGTGAAGGTCAAGACATTCCTAGGTGAATTTTGGTCAGTTGCAATTGACAGAACCAAACGCCGTCGTTTCCCCTGCACCACCGCCACCAATCCACCTATCTCCGCCGCACACACAGAAGAAACACACCATGGCTACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989733
ATGGCTACCAGCATGGGCCCTCCGCCTCCTAAAAATCTCACCGCTGACGATGCCGCCGCCGAGCCTTCAATATCCGAACCAACGAACAGCTCGGCGATGGCGCCGCCTCTACCTAGAAACCCGATTCCTTCCGAACCGGAACCCGCCGCCGAGCCATCCCAAGACCGCCAAGCGGAAGCCGAATTAAACCCTCCCAGCAGTGTTACTCCAGGAGATTCCGATCAAGTTTCTAATTCCAGCGAGAATTCGAGTAATGGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769796.1
MATSMGPPPPKNLTADDAAAEPSISEPTNSSAMAPPLPRNPIPSEPEPAAEPSQDRQAEAELNPPSSVTPGDSDQVSNSSENSSNGASANGESKQEQLNANLAAPYKIPPWSGPPGHEFFLEVLKDGAIITRYDVNEKGAYMFGRVDICDFVLEHPTISRFHAVLQFKSDGGAYLYDLGSTHGTFINKNQVKKRIYVDLHVGDVLRFGHSSRLYIFQGPSELMPPEADLKRLRKAKIQQETKDMEASLLRAKIEASRADG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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