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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003070`

染色体: Chr01 坐标: 49544645-49550376 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003070`
名称	SmilChr01G003070
描述	ALBINO3-like protein 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49544645 - 49550376 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989738`
GeneID	`130989738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989738`
原始查询	`LOC130989738`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ALBINO3-like protein 2, chloroplastic
产物	ALBINO3-like protein 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G44370` (AT3G44370) Membrane insertion protein, OxaA/YidC with tetratricopeptide repeat domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823562] identity=47.9; qcov=0.845; evalue=7.24e-140; confidence=high
Rice	`Os10g0521300` - identity=25.6; qcov=0.469; evalue=5.73e-14; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0032977 (membrane insertase activity); GO:0032979 (protein insertion into mitochondrial inner membrane from matrix); GO:0033617 (mitochondrial respiratory chain complex IV assembly)
KEGG	-
Pfam	PF14559 (TPR_19)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057769807.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057769807.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057769807.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057769807.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057769807.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49545292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C5
`Chr1:49545307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:49545377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:49545785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B60
`Chr1:49546097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B113,C16,C58
`Chr1:49546391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B60
`Chr1:49546456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:49549301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:49549333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C82
`Chr1:49550073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:49550082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A25
`Chr1:49550097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769807.1

544 aa

272

544

TPR_19

PF14559 TPR_19 370-416 aa

XP_057769815.1

536 aa

268

536

TPR_19

PF14559 TPR_19 370-416 aa

XP_057769823.1

524 aa

262

524

TPR_19

PF14559 TPR_19 350-396 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769807.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	370	416	4.4e-08	34.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769815.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	370	416	4.1e-08	34.1	Tetratricopeptide repeat
`XP_057769823.1`	Pfam	`PF14559`	TPR_19	Repeat	350	396	4.1e-08	34.2	Tetratricopeptide repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913840.1
TAAACCCCTTAAAATCCTCCAGCCTCCAAAATCCCGGGGTTTATCAACCATGCGACTCTCGACCATAACTAAATTCCGCCGCGCTCGGCCGGCGGCGGCGGAGCGCCGCCACTTCTTGTGCTACTACTCTTCCTCTTACTCTTCGCATTCGCTGATTAATAGCTCACACCACCACCACCGTGACGATCGGCGTAATTACAGTCCTCGACGATCGTCGGTGCTATACTGGCACTCATCTCTCGATTGCAGTTCCTCTCCTC...

XM_057913824.1
AAACCCCTTAAAATCCTCCAGCCTCCAAAATCCCGGGGTTTATCAACCATGCGACTCTCGACCATAACTAAATTCCGCCGCGCTCGGCCGGCGGCGGCGGAGCGCCGCCACTTCTTGTGCTACTACTCTTCCTCTTACTCTTCGCATTCGCTGATTAATAGCTCACACCACCACCACCGTGACGATCGGCGTAATTACAGTCCTCGACGATCGTCGGTGCTATACTGGCACTCATCTCTCGATTGCAGTTCCTCTCCTCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130989738
ATGCGACTCTCGACCATAACTAAATTCCGCCGCGCTCGGCCGGCGGCGGCGGAGCGCCGCCACTTCTTGTGCTACTACTCTTCCTCTTACTCTTCGCATTCGCTGATTAATAGCTCACACCACCACCACCGTGACGATCGGCGTAATTACAGTCCTCGACGATCGTCGGTGCTATACTGGCACTCATCTCTCGATTGCAGTTCCTCTCCTCGACGATTCTCAGCTCAGTCCGGCGCCTTTGAACCGGGCGAGCGGTTTCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057769807.1
MRLSTITKFRRARPAAAERRHFLCYYSSSYSSHSLINSSHHHHRDDRRNYSPRRSSVLYWHSSLDCSSSPRRFSAQSGAFEPGERFLPVQTLIYLLDSYHDVTGLPWWIIICSSTVAMRLAIFPLIVLQLKKLRMIGELLPKLPPPIPPPLSGRSFRDQFALFWMEKEAARCPSVLWFFSSVAVQVPCFFLWLMTIRKMSLDHHPGFDMGGILWSLNLTEYPHGALGPIFPLCIAGLHFANVQLSLRNSSLQHVPGTLKL...

XP_057769815.1
MRLSTITKFRRARPAAAERRHFLCYYSSSYSSHSLINSSHHHHRDDRRNYSPRRSSVLYWHSSLDCSSSPRRFSAQSGAFEPGERFLPVQTLIYLLDSYHDVTGLPWWIIICSSTVAMRLAIFPLIVLQLKKLRMIGELLPKLPPPIPPPLSGRSFRDQFALFWMEKEAARCPSVLWFFSSVAVQVPCFFLWLMTIRKMSLDHHPGFDMGGILWSLNLTEYPHGALGPIFPLCIAGLHFANVQLSLRNSSLQHVPGTLKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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