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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003021`

染色体: Chr06 坐标: 43071670-43075188 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003021`
名称	SmilChr06G003021
描述	probable L-cysteine desulfhydrase, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43071670 - 43075188 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989755`
GeneID	`130989755`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989755`
原始查询	`LOC130989755`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable L-cysteine desulfhydrase, chloroplastic
产物	probable L-cysteine desulfhydrase%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G26600` (AT5G26600) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832730] identity=67.2; qcov=0.925; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0290100` - identity=60.8; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00266 (Aminotran_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989755

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769830.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769830.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057769831.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769830.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769830.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43072118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B126,C32,C68
`Chr6:43072286`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr6:43072286`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B92
`Chr6:43072316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr6:43072727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B126,C32,C68
`Chr6:43072786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr6:43072951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:43072959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:43073106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B126,C32,C68
`Chr6:43073144`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B126,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769830.1

450 aa

225

450

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 79-266 aa

XP_057769831.1

442 aa

221

442

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 79-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769830.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	79	266	1.9e-15	57.4	Aminotransferase class-V
`XP_057769831.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	79	266	1.9e-15	57.5	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913848.1
AAAGAAAATCCAAAATCCAAAGACACGTCATGATGTGCAGGCGAAAATACACGTCAACCAGCTTCGCCACTCCGAGTGGGAAGCTTCTTCCTTTTTCTTTTCTGGTATTGTTGTTATTCTATTCATTTCGATTTTGGTTTATTCAATTGCTTAATCATTTCCCAACTTAGTAAAATGTGGCTTAATCACTCTCGCCACTATTGTTTATTGCACACTCACTCTCCCAATTCCCAAACCCTTTTCCCCAAATGGCCTGCCCC...

XM_057913847.1
ATGATGTGCAGGCGAAAATACACGTCAACCAGCTTCGCCACTCCGAGTGGGAAGCTTCTTCCTTTTTCTTTTCTGGTATTGTTGTTATTCTATTCATTTCGATTTTGGTTTATTCAATTGCTTAATCATTTCCCAACTTAGTAAAATGTGGCTTAATCACTCTCGCCACTATTGTTTATTGCACACTCACTCTCCCAATTCCCAAACCCTTTTCCCCAAATGGCCTGCCCCATCAACGGCGCCGCCGCCGCCGCCAATCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989755
ATGGCCTGCCCCATCAACGGCGCCGCCGCCGCCGCCAATCCCAAGCCTAAACCATCCCCAATCTCTCAATCGGAGATCCAATCCGAGTTCTCCCATCACGACCCTTCAATCGCCCGCATAAACAACGGCAGCTTCGGCTGCTGCCCCGCCTCCATCATCGCCGCCCAGCACCGCCACCAGCTGCTCTTCCTCCGCCAGCCCGACCATTTCTACTTCAACACCCTCAAGCCGTCCATCCTCCAAACCCGCGTCCTCATCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769830.1
MACPINGAAAAANPKPKPSPISQSEIQSEFSHHDPSIARINNGSFGCCPASIIAAQHRHQLLFLRQPDHFYFNTLKPSILQTRVLIQNLINADHVDEISIVDNATTAAAVVLQHTARAFSSATFQPGDAVLLLHYAYGAVKKSVEAYISRTGGHVIEVRLPFPVKSSFEIVSEFEKALRLGKSNGRKIRLAIIDHITSMPSVIIPIKELVRMCRDEGVDRIFVDAAHAIGNVEIDVKDIGADFYTSNLHKWLFCPPSAAF...

XP_057769831.1
MACPINGAAAAANPKPKPSPISQSEIQSEFSHHDPSIARINNGSFGCCPASIIAAQHRHQLLFLRQPDHFYFNTLKPSILQTRVLIQNLINADHVDEISIVDNATTAAAVVLQHTARAFSSATFQPGDAVLLLHYAYGAVKKSVEAYISRTGGHVIEVRLPFPVKSSFEIVSEFEKALRLGKSNGRKIRLAIIDHITSMPSVIIPIKELVRMCRDEGVDRIFVDAAHAIGNVEIDVKDIGADFYTSNLHKWLFCPPSAAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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