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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003023`

染色体: Chr06 坐标: 43083482-43086422 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003023`
名称	SmilChr06G003023
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 4-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43083482 - 43086422 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989757`
GeneID	`130989757`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989757`
原始查询	`LOC130989757`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 4-like
产物	PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 4-like
Arabidopsis	`AT1G09460` (AT1G09460) Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837469] identity=58.9; qcov=0.374; evalue=1.96e-38; confidence=low
Rice	`Os03g0833600` - identity=62.6; qcov=0.31; evalue=8e-40; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989757

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057769837.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057769837.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769837.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769837.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769837.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43083781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C37
`Chr6:43083798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C27
`Chr6:43083808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B16,C2,C32,C68
`Chr6:43083877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C27
`Chr6:43083879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:43083898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr6:43083913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr6:43084872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B45,C45,C74
`Chr6:43084949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B42,B49,B95,C64
`Chr6:43085009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B135,C15
`Chr6:43085010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C49
`Chr6:43085034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769837.1

345 aa

172

345

PF07983 X8 102-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769837.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	102	171	3.6e-21	76.3	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913854.1
CATCCAATCTAATTCCTTTATCTTCTCACCTGTGCATGCATAGACATATCTGCATACATATGCATCTTCTCCCTCCCCAATCTTGCTTCAAATCATACCACTACCATTTTTATGAAACAACTCTGCTTCTTTTTTTATGACAATCATATTAATCAATCTCTTTTTCTTTTCTTTTTTGGCCCTTTTTTCAAAGAGAGAGATGATCTACTAAATTCAAATTTCAATCTTCCTCACAAAGAAACCTCTTTTCTTTTATCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989757
ATGGATGCTCCCAAATTTATCTTCTCATTCCTCCTATCTACTCTCATTCTCCACTCCTCAGCCTCAGGGCTTCATTGGAGTCGCAAACACACAACTCAACACGACTCGCTCAACTTCCCCACCACCACTCCGGCCATCGTCACGGTGCCGTCGGCCACACCGGTCACCATAACCCCAACTCCGGCCGCCACTCCGGTGACCATTCCTCCTCCCACCACCACCACCGGCACCCCGCCCGTGACCAACCCCGTGACCACCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769837.1
MDAPKFIFSFLLSTLILHSSASGLHWSRKHTTQHDSLNFPTTTPAIVTVPSATPVTITPTPAATPVTIPPPTTTTGTPPVTNPVTTPAVAPPATSTGAGQGWCVAKSGAPEKSIQAALDYACGIGGADCSTIQQGASCYNPNTLQNHASYAFNSYYQRNPVPTSCDFGGAAAITTSNPSSGSCVFATSASTTPTVTPPSTATPVTVTPPSTATPVTVTPPSMATPVTVTPPSTATPVSTIPTVTPPSAATPVSTSPPTTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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