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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003027`

染色体: Chr06 坐标: 43104789-43113473 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003027`
名称	SmilChr06G003027
描述	ribosome biogenesis protein NOP53-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43104789 - 43113473 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989759`
GeneID	`130989759`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989759`
原始查询	`LOC130989759`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosome biogenesis protein NOP53-like
产物	ribosome biogenesis protein NOP53-like
Arabidopsis	`AT2G40430` (AT2G40430) Nop53 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818636] identity=53.6; qcov=0.628; evalue=1.15e-70; confidence=high
Rice	`Os05g0144200` - identity=57.1; qcov=1.04; evalue=1.32e-140; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0008097 (5S rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF07767 (Nop53)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989759

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769839.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057769839.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769839.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769839.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769839.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43105031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B2
`Chr6:43105631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B8,C14
`Chr6:43105656`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B103,B107,B28,C15,C55
`Chr6:43105656`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B103,B107,B28,C15,C55
`Chr6:43105661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B61,B64,B67,C47,C6
`Chr6:43105897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B140,C14
`Chr6:43105905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,D2
`Chr6:43106060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:43106067`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B138,B32,C16,C21,C28,C35,C54,C63
`Chr6:43106493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B107,B93,D2
`Chr6:43106568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr6:43107107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B1,B88,B91,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769839.1

371 aa

186

371

Nop53

PF07767 Nop53 8-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769839.1`	Pfam	`PF07767`	Nop53	Family	8	356	4.9e-64	217.9	Nop53 (60S ribosomal biogenesis)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913856.1
TTATAATATTTGTATTTTCTACCATTAACCCATCTTAGTAGGGTTTTTGGATTAGTTCTGCAGATTTCTCTATTTCGCGAGAGAGAAGGAAGGGGAGAGAAAGGCCTGCAGGCTGCAGCTGCACACGCTGCAAATTTCCTCTATTTTCTTGAGAGAGAGAGATAGAGGCAAAAGTCATGGGTAAGAGAGCGAAGAGTTCAAGGAAGGGAAAGAAAGAATGGAGGGCTAACATAAGCACTGAAGATATAGAAGATTTTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989759
ATGGGTAAGAGAGCGAAGAGTTCAAGGAAGGGAAAGAAAGAATGGAGGGCTAACATAAGCACTGAAGATATAGAAGATTTTGAGAAATCCACTAAAGATGCTCTTTCCGGTGGTTCTTTGGCCAATGTGCCCAGTGATTCTCTTTTCTTCGTCGATAAATCCAGAGATCTTTCTATTAGGCGGAAGATTGAGAAAAACAGAGAAAAAGTACTGCGATGTGATAGTCTGTTGCAGAGAAACCCTTTTATTAAAGCTATTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769839.1
MGKRAKSSRKGKKEWRANISTEDIEDXFEKSTKDALSGGSLANVPSDSLFFVDKSRDLSIRRKIEKNREKVLRCDSLLQRNPFIKAIPSSIQNKKKSKRKGKALPAVDEAVAQGSLQDESARDSGVLDLWEEKGEVKAKIKKKPKSCVIPAVEVEHPGCSFNPHPESHQDALARAVADEMQKIYQHELGPQPIPLVVPGEAIDEEYKYFLEADADDGTDDDDDEQNEIQADDGDVDTEKSSQKTKRVTRVEFNRRARRKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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