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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003030`

染色体: Chr06 坐标: 43131388-43132938 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003030`
名称	SmilChr06G003030
描述	scarecrow-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43131388 - 43132938 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989763`
GeneID	`130989763`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989763`
原始查询	`LOC130989763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	scarecrow-like protein 3
产物	scarecrow-like protein 3
Arabidopsis	`AT1G50420` (SCL3) scarecrow-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841464] identity=40.2; qcov=1.05; evalue=3.01e-102; confidence=medium
Rice	`Os12g0138100` - identity=33; qcov=1.08; evalue=9.53e-68; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989763

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769844.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057769844.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057769844.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769844.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43131617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C77
`Chr6:43131623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:43131657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B71,C49
`Chr6:43131774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:43131977`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B87,D9
`Chr6:43131977`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B87,D9
`Chr6:43131988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:43132015`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C40,C52
`Chr6:43132074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr6:43132077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B2,B82
`Chr6:43132096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B93
`Chr6:43132099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769844.1

416 aa

208

416

GRAS

PF03514 GRAS 34-413 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769844.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	34	413	8.7e-92	308.6	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913861.1
AACATTTGTATTATGCTATTGGATTTGTTAATACTTCCATTAGCTAATTAATCTCCCTACATCTCACCTAATCCTTATCAACATTTTCAACCAGAAAAAAAAAGATCCCATCCATTCACAAATCGTCTTCCTCAGCATACTCTCTCAACATCTTGCATTAATTAGCTGAAATCCTTAGTTATGAGTTCTTCATCTCAATCACAAAATCTTGATGTAACCTTGTCACTAAGCTTGCCACCAAGAAATGAAGGCCTAAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989763
ATGAGTTCTTCATCTCAATCACAAAATCTTGATGTAACCTTGTCACTAAGCTTGCCACCAAGAAATGAAGGCCTAAACCCCCAAGAGAGGGGTATCAAGCTGATCCAGCTCTTGCTAAGTTGCGCCAACCACGCCTCCTCCGGCAACCTCCACCACGCCGACACGTGCCTCCACCACATATCGGAGCTTGCCTCCGTCACCGGTGACTCCATGCAGCGGCTAGCCGCTAGGTTTGCCGCAGCCTTGGCGGCCCGGCTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769844.1
MSSSSQSQNLDVTLSLSLPPRNEGLNPQERGIKLIQLLLSCANHASSGNLHHADTCLHHISELASVTGDSMQRLAARFAAALAARLLKRWPGLYKALNNGGLVGFDVDRARSIFARAFPCLGFAYAVINRTLIQALLGEREVHVIDLGCGDPKLWVPFVRAMADGPNGPPRLKITSVGINKEAQERLEGRILKEGQSLKMEIVLNHVDAKLRDLSLDMLEVKPGEALALTSILSLHVLLAEDDGVDARFGLRSKNNQVSE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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