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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003033`

染色体: Chr06 坐标: 43141238-43143205 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003033`
名称	SmilChr06G003033
描述	probable UDP-arabinopyranose mutase 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43141238 - 43143205 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989765`
GeneID	`130989765`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989765`
原始查询	`LOC130989765`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable UDP-arabinopyranose mutase 1
产物	probable UDP-arabinopyranose mutase 1
Arabidopsis	`AT3G02230` (RGP1) reversibly glycosylated polypeptide 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821233] identity=88.6; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0599800` (OsUAM1) - identity=85.8; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0005829 (cytosol); GO:0009832 (plant-type cell wall biogenesis); GO:0033356 (UDP-L-arabinose metabolic process); GO:0052691 (UDP-arabinopyranose mutase activity)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03214 (RGP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989765

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057769847.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769847.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057769847.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769847.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43141514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B126,C32,C68
`Chr6:43141578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:43141581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,A23
`Chr6:43141591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:43141593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:43141608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B65,B71,C4,C49
`Chr6:43141701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B133,B33,B4,C20
`Chr6:43141777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr6:43142460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B12,C26,D2
`Chr6:43142529`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,D7
`Chr6:43142574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr6:43142576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B12,B36,C84,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769847.1

355 aa

178

355

RGP

PF03214 RGP 9-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769847.1`	Pfam	`PF03214`	RGP	Family	9	342	1e-177	591.2	Reversibly glycosylated polypeptide

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913864.1
GATTTCCCGACACCACATCCGCCGCCGCCATGGCCAGCACCTCGCCGCCCCTGAAAGACGAGCTCGACATCGTGATACCGACGATCCGAAACCTGGACTTCCTGGAGATGTGGAGGCCCTTCCTCCAACCCTACCACCTCATCATCGTCCAAGACGGCGACCCTGCGAAGAGCATCAAGGTCCCCGACGGCTTCGACTACGAGCTCTACAACCGCAACGACATCAACCGCATCCTCGGCCCCAAGGCCTCCTGCATCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989765
ATGGCCAGCACCTCGCCGCCCCTGAAAGACGAGCTCGACATCGTGATACCGACGATCCGAAACCTGGACTTCCTGGAGATGTGGAGGCCCTTCCTCCAACCCTACCACCTCATCATCGTCCAAGACGGCGACCCTGCGAAGAGCATCAAGGTCCCCGACGGCTTCGACTACGAGCTCTACAACCGCAACGACATCAACCGCATCCTCGGCCCCAAGGCCTCCTGCATCTCCTTCAAGGACTCGGCGTGCCGCTGCTTCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769847.1
MASTSPPLKDELDIVIPTIRNLDFLEMWRPFLQPYHLIIVQDGDPAKSIKVPDGFDYELYNRNDINRILGPKASCISFKDSACRCFGYMISKKKYIFTIDDDCFVASDPSGKPINALEQHIRNLLCPSTPLFFNTLYDPFREGADFVRGYPFSLREGVPTAVSHGLWLNIPDYDAPTQLVKPRERNTTYVDAVLTIPKGTLFPMCGMNLGFDRDLIGPAMYFGLMGDGQPIGRYDDMWAGWCTKVICDHLGLGVKTGLPY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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