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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003038`

染色体: Chr06 坐标: 43225300-43227427 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003038`
名称	SmilChr06G003038
描述	COBRA-like protein 4
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43225300 - 43227427 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989771`
GeneID	`130989771`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989771`
原始查询	`LOC130989771`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	COBRA-like protein 4
产物	COBRA-like protein 4
Arabidopsis	`AT5G15630` (IRX6) COBRA-like extracellular glycosyl-phosphatidyl inositol-anchored protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831417] identity=83.7; qcov=0.954; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0416200` (BC1) - identity=68.6; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0010215 (cellulose microfibril organization); GO:0052324 (plant-type cell wall cellulose biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF04833 (COBRA_N); PF25079 (COB_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989771

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769855.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769855.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769855.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769855.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43225576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C44,C62
`Chr6:43225890`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:43225933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B140,D10
`Chr6:43226048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr6:43226052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:43226115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C17
`Chr6:43226245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr6:43226436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:43226658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:43226748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:43226847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C82
`Chr6:43226850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769855.1

432 aa

216

432

COBRA_N

COB_C

PF04833 COBRA_N 43-206 aa PF25079 COB_C 215-404 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769855.1`	Pfam	`PF04833`	COBRA_N	Domain	43	206	8.2e-68	228.3	COBRA N-terminal domain
`XP_057769855.1`	Pfam	`PF25079`	COB_C	Domain	215	404	1.1e-54	186.4	COBRA family C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913872.1
AGTAGTGCCATATTTCTTCTTTTATTATTATCTATAAAGTGACATGAAAATATGAATTCCATAAGTTTTATATATGCAGCAGACTGCAAATGTCACTAGCATCTAACTGCCAGAGGGTGGAGACACTTCAAATACTCTACAAAATCTTTTACTTTACGCATATCTTTCTTACATTCTAAACATCTTCCCTCCAACAAAAAGGATCCAAATTCTGCCTCTCACTCAAATTCAAGGAAACATGAAATTGTTCATTGCAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989771
ATGAAATTGTTCATTGCAGCTTTCTTCCTTTCTGTGCTCTTCTCTTCCACAGCCGCCTACGATCCGTTGGATCCGAATGGGAATATCACAATCAAATGGGATATAATGTCTTGGACACCAGATGGCTATGTGGCTGTGGTGACGATGAACAATTTCCAAACGTTTCGACACATCATGAGCCCCGGTTGGACTCTGGGGTGGTCGTGGGCGAAGAAAGAGGTGATATGGACCATGGTCGGGGCGCAGACCACGGAGCAAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769855.1
MKLFIAAFFLSVLFSSTAAYDPLDPNGNITIKWDIMSWTPDGYVAVVTMNNFQTFRHIMSPGWTLGWSWAKKEVIWTMVGAQTTEQGDCSKFKGNIPHCCKKTPTVVDLLPGVPYNQQFSNCCKGGVLAAWGQDPVASVSTFQVSVGQAGTTNKTVKLPKNFTLLGPGPGYTCGPAKIVPSTNFLTPDRRRKTQALMTWNVTCTYSQFLARKHPSCCVSFSSFYNETITSCPSCACGCENRNKCVKPESKLLSVVGVNTP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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