Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003056`

染色体: Chr06 坐标: 43452722-43454303 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003056`
名称	SmilChr06G003056
描述	basic leucine zipper 43-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43452722 - 43454303 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989782`
GeneID	`130989782`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989782`
原始查询	`LOC130989782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	basic leucine zipper 43-like
产物	basic leucine zipper 43-like
Arabidopsis	`AT3G30530` (bZIP42) basic leucine-zipper 42 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822767] identity=56.9; qcov=0.978; evalue=1.43e-53; confidence=high
Rice	`Os02g0728001` (OsbZIP22) - identity=43.2; qcov=0.871; evalue=3.97e-27; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989782

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769867.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769867.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769867.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769867.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769867.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769867.1

178 aa

178

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 81-126 aa PF00170 bZIP_1 82-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769867.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	81	126	2.8e-08	34.4	Basic region leucine zipper
`XP_057769867.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	82	140	1.4e-14	54.7	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913884.1
ACGAAATAAGAAACGTGATATCAAGTAATAAATTTTGCGTCTAAAACATTCCTTTCTACCAAAGTACACTGCTTATGCTTCCTGCAATGTGCTTCAGGTAAGGGTTTTCATCTGATATATTGAAATTTGATCATGTAAAGAATATATAATATCTTAAATATTAAATATGGTTCCAGAAAAGTGGTTGTTGAGTCACCAATTTCTTTTATGCAAGTTTTCCACTTTCAGAAAAGGGATTGTGCTGCCTCAGTATCCTCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989782
ATGCAACCCAATGAGATTGCTGAGCTTCATTTGTTATTTCCTTCAAACTCAGCACAATATCCTCCCAATTTTGGCTCAACCAGTAACTACCCACCAGCTTATCAGTTTAGCAGGTTCCCCAACCCTTTATATAACCTCCATGCCACACCCCAACTTCAAGAATTCAATCCTCAGACAACATGTTTCAGCAGTAATTCGACGTCTGATGAAGCAGATGAGCAACAACTAAGCATAATAAACGAGAGGAAGCAAAGAAGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769867.1
MQPNEIAELHLLFPSNSAQYPPNFGSTSNYPPAYQFSRFPNPLYNLHATPQLQEFNPQTTCFSSNSTSDEADEQQLSIINERKQRRMISNRESARRSRMRKQKHLDELWTQVVWLRNENHQLIDKLNHVSERHDQVLQENTQLKEEASELRQMLTDMQLNSPYPSLRELDDDPSSELA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器