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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003061`

染色体: Chr06 坐标: 43505133-43508772 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003061`
名称	SmilChr06G003061
描述	protein NSP-INTERACTING KINASE 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43505133 - 43508772 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989788`
GeneID	`130989788`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989788`
原始查询	`LOC130989788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NSP-INTERACTING KINASE 1-like
产物	protein NSP-INTERACTING KINASE 1-like
Arabidopsis	`AT5G16000` (NIK1) NSP-interacting kinase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831457] identity=75.9; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0274500` (OsSERL2) - identity=65.8; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989788

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769871.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769871.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769871.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769871.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769871.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43505488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:43505509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr6:43505674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B126,B17,C24,C57
`Chr6:43505962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C22,C53,C60
`Chr6:43505965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B37,B69,C38
`Chr6:43505977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C86
`Chr6:43506096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C38
`Chr6:43506522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:43506561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B8
`Chr6:43506564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B131,B81,D11
`Chr6:43506567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C87
`Chr6:43506606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769871.1

625 aa

312

625

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 33-72 aa PF00560 LRR_1 100-122 aa PF00560 LRR_1 124-146 aa PF00560 LRR_1 149-170 aa PF00069 Pkinase 306-533 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 308-574 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769871.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	33	72	1e-13	52.0	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057769871.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	100	122	3.9e-11	41.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057769871.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	124	146	3.9e-11	41.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057769871.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	149	170	3.9e-11	41.5	Leucine Rich Repeat
`XP_057769871.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	306	533	1.3e-42	146.7	Protein kinase domain
`XP_057769871.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	308	574	1.5e-44	153.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913888.1
GTATACTTACTCCCACATTTACTTTTTCCATGAAATAATATGGCTACCTAGTGAACTCACTGGCCCATGTAGATACTTGGATTTATTTTGTCTGGGCATTATTTTTTATTTTTTTAATTTGTTTTTTGTCTTGATTAACTACTCGAAAATTTTGAAATCTTGAATGAATATCACAAAGATTTTCTTAGACAACAAAAATTTAGATGATGTGGTGGTAATATTTATCCCATCTTAGGCTATACTTTTTTTGAAGTAAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989788
ATGGAAACGCCAAGAAAGAGTGAAGCAGCGGTTTGGGCCGTCGTGTTTCTTTGCTTTTGGAGCTCTGCAAACGGTTTGCTTTCCGCAAAAGGTGTAAACTTTGAAGTACAAGCTCTGATGGGGATAAAAGCTGCTTTGAGGGATCCACATGGGGTTCTTGATAATTGGGATGGTGATGCTGTTGATCCATGTAGCTGGACTATGGTCACTTGTTCTTCACAGAATCTTGTGATTGGCCTAGGGAGTCCTAGTCAGAATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769871.1
METPRKSEAAVWAVVFLCFWSSANGLLSAKGVNFEVQALMGIKAALRDPHGVLDNWDGDAVDPCSWTMVTCSSQNLVIGLGSPSQNLSGTLSPSIGNLTNLQIILLQNNNITGPIPSELGRLLKLQTLDLSNNLFRGSIPPALGHLKILQYMRLNNNSLFGEIPMSLTNLTQLSLVDLSYNNLSGPVPRFPSKTFNVIGNPLICERGYEPQCAGGIALMPMSMTLNTSQTLTSAKSKYRKLSLAIGTSVAAICLLAAGFG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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