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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003085`

染色体: Chr06 坐标: 43724064-43729686 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003085`
名称	SmilChr06G003085
描述	protein trichome birefringence-like 19
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43724064 - 43729686 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989812`
GeneID	`130989812`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989812`
原始查询	`LOC130989812`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 19
产物	protein trichome birefringence-like 19
Arabidopsis	`AT5G15900` (TBL19) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831447] identity=48.8; qcov=0.977; evalue=3.27e-136; confidence=high
Rice	`Os01g0653100` (OsTBL58) - identity=50.6; qcov=0.799; evalue=5.2e-119; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989812

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057769899.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769899.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769899.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769899.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769899.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43724205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr6:43724290`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B132
`Chr6:43724290`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B132
`Chr6:43724293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr6:43724327`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B55,C23
`Chr6:43724327`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B55,C23
`Chr6:43724328`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	89	A13,A19,A24,A25,B1,B103,B104,B108,B11,B110,B111,B113,B114,B117,B118,B12,B123,B126,B128,B129,B131,B133,B137,B15,B19,B20,B25,B3,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B41,B44,B45,B5,B52,B54,B6,B60,B65,B68,B69,B71,B74,B79,B85,B88,B90,B92,B93,C1,C13,C14,C15,C17,C18,C2,C24,C25,C3,C30,C31,C35,C38,C39,C44,C5,C50,C51,C58,C61,C62,C63,C64,C67,C7,C70,C71,C76,C8,D11,D3,D6,D7
`Chr6:43724335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B135,C52
`Chr6:43724338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B21,B59,C52
`Chr6:43724340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr6:43724343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B25,C23
`Chr6:43724347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B136,B82,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769899.1

433 aa

216

433

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 85-137 aa PF13839 PC-Esterase 138-419 aa

XP_057769900.1

428 aa

214

428

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 85-137 aa PF13839 PC-Esterase 138-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769899.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	85	137	7.2e-23	81.4	PMR5 N terminal Domain
`XP_057769899.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	138	419	5.7e-82	276.6	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p
`XP_057769900.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	85	137	7.1e-23	81.4	PMR5 N terminal Domain
`XP_057769900.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	138	414	3.8e-83	280.4	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913916.1
TATATATATATACATCTTCCTTTCTCACCTTCACACAAACACACAGATTCAATGAAGCTCGAAGCTTTAAAACCTCCATTACCCAAACCCCAAACACGTATCAAAACGTCGAAATTCATCCCTCTAATCGCTCTAACTTGCCTTCTCACAATCATCCCAATTTATTACCCTTTTAGCCACAAGAAATTACTCTTGGCTTTGCCGATCGGAAACGAGAATACGATCAAGTCTACCTCTCCCCTCCTCCCTCCGCCCAAACC...

XM_057913917.1
TATATATATACATCTTCCTTTCTCACCTTCACACAAACACACAGATTCAATGAAGCTCGAAGCTTTAAAACCTCCATTACCCAAACCCCAAACACGTATCAAAACGTCGAAATTCATCCCTCTAATCGCTCTAACTTGCCTTCTCACAATCATCCCAATTTATTACCCTTTTAGCCACAAGAAATTACTCTTGGCTTTGCCGATCGGAAACGAGAATACGATCAAGTCTACCTCTCCCCTCCTCCCTCCGCCCAAACCCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989812
ATGAAGCTCGAAGCTTTAAAACCTCCATTACCCAAACCCCAAACACGTATCAAAACGTCGAAATTCATCCCTCTAATCGCTCTAACTTGCCTTCTCACAATCATCCCAATTTATTACCCTTTTAGCCACAAGAAATTACTCTTGGCTTTGCCGATCGGAAACGAGAATACGATCAAGTCTACCTCTCCCCTCCTCCCTCCGCCCAAACCCAACACCCCGACGCGGCGGCGCAGCGACAGCTCAGCGCCGCCGGAGTGCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769899.1
MKLEALKPPLPKPQTRIKTSKFIPLIALTCLLTIIPIYYPFSHKKLLLALPIGNENTIKSTSPLLPPPKPNTPTRRRSDSSAPPECDLFDGEWIPNPDGPYYTNETCDAIQEHQNCMKFGRPDTGYLKWRWKPDGCELPLFHPNNFLEMLRGKSLLFVGDSVARNHMQSLICLLSKLLYRQVAQPIDVSEATAENRLYRYTDYNLSISIISSPYLIRTHKTDPNDFTAPYHLFLDEFDPTWTAALGEFDYLIISAAHWFF...

XP_057769900.1
MKLEALKPPLPKPQTRIKTSKFIPLIALTCLLTIIPIYYPFSHKKLLLALPIGNENTIKSTSPLLPPPKPNTPTRRRSDSSAPPECDLFDGEWIPNPDGPYYTNETCDAIQEHQNCMKFGRPDTGYLKWRWKPDGCELPLFHPNNFLEMLRGKSLLFVGDSVARNHMQSLICLLSKVAQPIDVSEATAENRLYRYTDYNLSISIISSPYLIRTHKTDPNDFTAPYHLFLDEFDPTWTAALGEFDYLIISAAHWFFRPSYF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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