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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003087`

染色体: Chr06 坐标: 43733721-43736786 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003087`
名称	SmilChr06G003087
描述	uncharacterized SmilChr06G003087
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43733721 - 43736786 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989813`
GeneID	`130989813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989813`
原始查询	`LOC130989813`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=41; qcov=0.44; evalue=1.84e-57; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057769901.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769901.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769901.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769901.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057769901.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43734923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,C46,C56,C60
`Chr6:43734931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B33,C5
`Chr6:43734947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C56,C60
`Chr6:43734968`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,C56,C60
`Chr6:43735054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr6:43735199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B108
`Chr6:43735247`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A11,A18,A19,A7,A8,B108,B27,B32,B38,B39,B44,B45,B5,B58,B59,B65,B76,B79,C18,C49,C50,C55,C71,D3
`Chr6:43735257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B77
`Chr6:43735269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:43735286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:43735293`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B41,C22,C37,C9
`Chr6:43735355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769901.1

571 aa

286

571

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 135-248 aa PF13952 DUF4216 417-491 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769901.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	135	248	5.7e-45	152.6	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057769901.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	417	491	1.8e-17	64.3	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913918.1
CTCTTGTGGCTCGTCTAATGTGTTTGAAGGCAGAGGGGAACATGTCCGAGAGATGTTTTGACCAATGGCTTGAATTGATAAAAGAAATCCTTCCCGAACACAATTTAGCTCCCAATAACTTCTACAGCACAAAGAAGTTATTAAGTGGAATGGGGTTGCCAGTTGAGAAGATTGATTGTTGCCATAATAATTGCATGCTTTTCTGGGGAGAGGATAGCGAGGATATTGAGTGTAAGCATTGCAACGAGCCACGTTACCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989813
ATGCACGTGGAGAAGAATGTCTTTGATAATGTGTTCAATACAGTTTTGAACGTACCAGGAAGGACAAAGGATACAAGCAAATCTAGAGAAGAACTAAACACATATTGCTCAAGACCAGCACTTGAAAAAAATGTTGAGACAAACAAGTATCCAAAAGCTTGTTACATGCTTGACACTAAAGAGAAGAAAGTATTGTTTGAATGGGTCAAAACTTTACGATTCCCTGATGGTTATGTGTCAAATATGGGAATATGTGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769901.1
MHVEKNVFDNVFNTVLNVPGRTKDTSKSREELNTYCSRPALEKNVETNKYPKACYMLDTKEKKVLFEWVKTLRFPDGYVSNMGICVDMSKLKMFGMKSHDCHVFMQRILPITFRELLPSHVWKAITELSLFFKDLSSRNLRCEDVCRLSDNIAITLCKLERIFPPSFFDSMEHLPVHLAFEAQLAGSVQYRWMYPFERYLRKLKNNVRNKARVEGSICNAYIVEEASTFCSYYFEEHVRTRYRNVPRNLNTRDDVRFDGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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