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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003097`

染色体: Chr06 坐标: 43818858-43822167 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003097`
名称	SmilChr06G003097
描述	protein GAMETE EXPRESSED 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	43818858 - 43822167 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989823`
GeneID	`130989823`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989823`
原始查询	`LOC130989823`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein GAMETE EXPRESSED 3
产物	protein GAMETE EXPRESSED 3
Arabidopsis	`AT5G16020` (GEX3) gamete-expressed 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831459] identity=48.7; qcov=0.773; evalue=1.74e-178; confidence=high
Rice	`Os01g0605400` - identity=41.9; qcov=0.825; evalue=1.48e-135; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009793 (embryo development ending in seed dormancy); GO:0010183 (pollen tube guidance)
KEGG	-
Pfam	PF28764 (GEX3_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989823

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057769914.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057769914.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057769914.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057769914.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769914.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:43818994`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	1	B26
`Chr6:43818994`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B26
`Chr6:43819083`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B101,B11,B16,C40,C48
`Chr6:43819083`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B101,B11,B16,C40,C48
`Chr6:43819311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B108,B21,B59,C18
`Chr6:43819401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B2,B38,B39,B46
`Chr6:43819404`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B71,C61
`Chr6:43819602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr6:43819675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:43819684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr6:43819810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:43819957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,A6,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769914.1

699 aa

350

699

GEX3_C

PF28764 GEX3_C 454-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769914.1`	Pfam	`PF28764`	GEX3_C	Domain	454	561	1.2e-46	158.1	Gamete expressed protein 3 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913931.1
GCTTCCTTCATGCGTCTTCATACTTGGATGGAGCGTTGTTCATTTTGGAGCCCTAAATTCGATTTTATCAAATAACTCTTGTTTCTTCTTAATTATGTCAGTGAAAATATCCATCATCTCTCTCTTAATATCTCTTTTTCCTCGAATTTCTTCGATTGTTGTTATATCGGCTCTGATTGCACCATTAATCTCTGCCGTATTTTCTCACTCCAACCATCCACACAAGTTTTCACCCTATCGTCATTCATTTTCAGATTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989823
ATGTCAGTGAAAATATCCATCATCTCTCTCTTAATATCTCTTTTTCCTCGAATTTCTTCGATTGTTGTTATATCGGCTCTGATTGCACCATTAATCTCTGCCGTATTTTCTCACTCCAACCATCCACACAAGTTTTCACCCTATCGTCATTCATTTTCAGATTCAAATAAAGCTGGTTATAGACTGTACAAGAGCTTAATTATGGATGAGGGGCGGATTTGTGCTTGCTCGGAGAAATACTTGTTTGCATTTGAAAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769914.1
MSVKISIISLLISLFPRISSIVVISALIAPLISAVFSHSNHPHKFSPYRHSFSDSNKAGYRLYKSLIMDEGRICACSEKYLFAFERNGSIAWALHLNYTCNANIAPVHGGSSKIYLVAENKVLKIYPLRIRTNEAAVQVFFECAEEIVGISASLSSSCVLINVKNRGLFAYRLHGQLFWSAGPVLYQHGYRQGCRKNVTDCYFTSAPVIDHCEASIFMANTVGEVYSLSIRGHHFKWIQDLSSFGNAFRITAGNNGLLYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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