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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003120`

染色体: Chr06 坐标: 44019043-44025866 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003120`
名称	SmilChr06G003120
描述	dehydrodolichyl diphosphate synthase CPT3-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44019043 - 44025866 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989847`
GeneID	`130989847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989847`
原始查询	`LOC130989847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydrodolichyl diphosphate synthase CPT3-like
产物	dehydrodolichyl diphosphate synthase CPT3-like
Arabidopsis	`AT2G17570` (cPT1) Undecaprenyl pyrophosphate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816264] identity=60.5; qcov=1.05; evalue=1.36e-106; confidence=high
Rice	`Os06g0167400` - identity=53.9; qcov=0.996; evalue=1.51e-86; confidence=high
GO	GO:0002094 (GO:0002094); GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0016094 (polyprenol biosynthetic process)
KEGG	smil00900 (Terpenoid backbone biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01255 (Prenyltransf)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057769958.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057769958.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057769960.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057769960.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769958.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44019375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B37,B69,C38
`Chr6:44019497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:44019638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:44019722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:44019874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B26,B27,B7,C77
`Chr6:44020032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,D1
`Chr6:44020094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769958.1

275 aa

138

275

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 40-264 aa

XP_057769959.1

275 aa

138

275

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 40-264 aa

XP_057769960.1

235 aa

118

235

Prenyltransf

PF01255 Prenyltransf 1-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769958.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	40	264	7.6e-69	232.3	Putative undecaprenyl diphosphate synthase
`XP_057769959.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	40	264	7.6e-69	232.3	Putative undecaprenyl diphosphate synthase
`XP_057769960.1`	Pfam	`PF01255`	Prenyltransf	Family	1	224	3.8e-68	230.0	Putative undecaprenyl diphosphate synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913976.1
TTTCAAACATTTTTACAAATGAGTTGAGAGTTTAGAATATAAACTATAATTAACCCATCCTTCAATCATTTTAATTCTTTAAACCAACTACAAATCTAATTAGTGTATCCAATTTCAGGCAATTCAATTTCAAACTCCATAGTCACACTCACACTCACACTCACACTCACACAACCAGCTCCAATCAACTCTACCGCAGCCCTGCCGCCCTTGCGCCGCCTCCTTCCACATCACCTCCGACTCCCTGCCCCATCCTCTGC...

XM_057913977.1
CGTAGGGAGTACTATTTGAGCCATTCTTATAAATAGTTCCGAAATTCAGATTATTTTCTCATATTTTTCAAACATTTTTACAAATGAGTTGAGAGTTTAGAATATATACTATAATTAACCCATACTTGAATAATTTTATTTTTAATTCTTAAACCAACTACAAATCTAATTAGTGCATCCAATTTCAAACTCCATAGTCACACTCACACTCACACAACCAGCTCCAATCAACTCTACCGCCGCCCTGCCGCCCTTGCGCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130989847
ATGGAGAAACGGAGTAGTAACCTTGCCACTCAATTAATTGAAGGTTTGTGTAGTTTTCTGCGCAGATGTATTTGTGCAATTCTTTCTGCTGGTTCTCTTCCAAGGCATGTTGCATTTATCATGGATGGAAATCGAAGATACGCCATGAAGCAAGGTTTACTAGAAGGAGCTGGGCATAGGGTTGGATTTTCAGCTCTCATGAATATGTTGAAGTATTGCTATGAGTTGAACGTGAAGTATGTTACAGTGTATGCTTTCAG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057769958.1
MEKRSSNLATQLIEGLCSFLRRCICAILSAGSLPRHVAFIMDGNRRYAMKQGLLEGAGHRVGFSALMNMLKYCYELNVKYVTVYAFSIENFKRRPEEVQSTMQLIQEKIESLLEKESIVNQYGVRVHFIGNLKLLSKPVRLAAERAINATAHNSRAVLAICIAYTSTDEIAHSVEETCKEKWDELGGNATDSKEPLIDVADVEKHMYMAVAPDPDIIIRSSGETRLSNFLLWQSASSLLYSPRALWPEIGFCHLVRAILD...

XP_057769959.1
MEKRSSNLATQLIEGLCSFLRRCICAILSAGSLPRHVAFIMDGNRRYAMKQGLLEGAGHRVGFSALMNMLKYCYELNVKYVTVYAFSIENFKRRPEEVQSTMQLIQEKIESLLEKESIVNQYGVRVHFIGNLKLLSKPVRLAAERAINATAHNSRAVLAICIAYTSTDEIAHSVEETCKEKWDELGGNATDSKEPLIDVADVEKHMYMAVAPDPDIIIRSSGETRLSNFLLWQSASSLLYSPRALWPEIGFCHLVRAILD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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