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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003128`

染色体: Chr06 坐标: 44155512-44156392 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003128`
名称	SmilChr06G003128
描述	uncharacterized SmilChr06G003128
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44155512 - 44156392 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989854`
GeneID	`130989854`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989854`
原始查询	`LOC130989854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HTH-type transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816900]; symbol=AT2G23690; hit=AT2G23690; species=arabidopsis; confidence=high
产物	HTH-type transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816900]; symbol=AT2G23690; hit=AT2G23690; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G23690` (AT2G23690) HTH-type transcriptional regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816900] identity=62.8; qcov=1.01; evalue=2.48e-59; confidence=high
Rice	`Os03g0740200` (OJ1365_D05.26) - identity=37.6; qcov=0.669; evalue=1.75e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14009 (PADRE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989854

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057769975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769975.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769975.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769975.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057769975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44155721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:44155745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B138,C41
`Chr6:44155781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:44155787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:44155803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B136,B97
`Chr6:44155837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:44155913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr6:44155976`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C81
`Chr6:44155976`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C81
`Chr6:44156024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769975.1

163 aa

163

PADRE

PF14009 PADRE 1-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769975.1`	Pfam	`PF14009`	PADRE	Domain	1	145	1.9e-29	104.1	PADRE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913992.1
TTTACAGGTTGGCAGCTCTGCCCATTCAACTCTTCCCCTCTTTCATAAAAACACATTTTACCTTTTCTTTTTCCTTTTTTTTGTTTTCACTTGCTGACGTGTCTCCTCCAATTTCCAATATTACCCCTCCCCTCCTCTATATATATACGCCCTCTCTCACTTCCATTTCCAGATTTAATTCAAAGTAAAACTCACAGAATTATGGGTATATGCAGCTCCTGCGAATCCACATCCGTAGCTACGGCCAAGCTGATACTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989854
ATGGGTATATGCAGCTCCTGCGAATCCACATCCGTAGCTACGGCCAAGCTGATACTCGACGACGGGAGATTGCAGGAATATCCTTATCCGGTCAAGGTCTCCTACGTCTTGCAGAAGAATCCCGCGTTTTTCATCTGCAACTCCGACGAGATGGATTTCGACGACGTCGTATCGGCCGTCGGCGACGACGACGAGCTGCAGCCAGGGCAGCTCTACTTCGCGCTGCCGCTCAGCCAGCTGAGCCACCGCCTGCAGGCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769975.1
MGICSSCESTSVATAKLILDDGRLQEYPYPVKVSYVLQKNPAFFICNSDEMDFDDVVSAVGDDDELQPGQLYFALPLSQLSHRLQAEEMAALAVKASSALTKSGGGCGDKCGCRRNILVFPGENDLRQPAKPAAGGGDSRSGRRRCAAGRRGKVTARLSAIPE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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