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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003150`

染色体: Chr06 坐标: 44511673-44514678 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003150`
名称	SmilChr06G003150
描述	rhodanese-like domain-containing protein 8, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44511673 - 44514678 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989864`
GeneID	`130989864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989864`
原始查询	`LOC130989864`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 8, chloroplastic
产物	rhodanese-like domain-containing protein 8%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G17850` (AT1G17850) Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838364] identity=60; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0861700` - identity=58.2; qcov=0.841; evalue=1.16e-156; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00581 (Rhodanese); PF12368 (Rhodanese_C); PF17773 (UPF0176_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057769996.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057769996.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769996.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769996.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44511797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B65
`Chr6:44511826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr6:44511840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C36
`Chr6:44511844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,C15,C31,C84
`Chr6:44511895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:44511929`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	101	A14,A3,A4,A5,A6,A8,B1,B10,B104,B107,B109,B110,B111,B115,B123,B126,B127,B128,B132,B133,B137,B16,B20,B22,B23,B27,B28,B32,B34,B36,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B49,B50,B51,B53,B57,B59,B6,B60,B62,B63,B68,B69,B7,B74,B77,B81,B83,B84,B88,B89,B90,B94,B95,C1,C12,C13,C2,C20,C25,C28,C34,C35,C36,C38,C41,C42,C45,C48,C50,C51,C55,C58,C59,C62,C63,C64,C66,C67,C70,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C84,C87,C9,D1,D2,D7
`Chr6:44511930`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	101	A14,A3,A4,A5,A6,A8,B1,B10,B104,B107,B109,B110,B111,B115,B123,B126,B127,B128,B132,B133,B137,B16,B20,B22,B23,B27,B28,B32,B34,B36,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B49,B50,B51,B53,B57,B59,B6,B60,B62,B63,B68,B69,B7,B74,B77,B81,B83,B84,B88,B89,B90,B94,B95,C1,C12,C13,C2,C20,C25,C28,C34,C35,C36,C38,C41,C42,C45,C48,C50,C51,C55,C58,C59,C62,C63,C64,C66,C67,C70,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C80,C81,C84,C87,C9,D1,D2,D7
`Chr6:44512081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:44512532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C45,D11
`Chr6:44513121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B19,C40,C9
`Chr6:44513153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B102,B37,B69,C38,C5
`Chr6:44513574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769996.1

441 aa

220

441

UPF0176_N

Rhodanese

Rhodanese_C

PF17773 UPF0176_N 92-181 aa PF00581 Rhodanese 218-322 aa PF12368 Rhodanese_C 332-412 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769996.1`	Pfam	`PF17773`	UPF0176_N	Domain	92	181	1.6e-17	64.4	UPF0176 acylphosphatase like domain
`XP_057769996.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	218	322	2.5e-09	38.2	Rhodanese-like domain
`XP_057769996.1`	Pfam	`PF12368`	Rhodanese_C	Family	332	412	1.6e-15	57.9	Rhodanase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914013.1
GAAAACTTTCGTTAGGACTCAAGAAGCTATCTTTACTGTGCTGTTTGTGGAATAGTAAGCAAGTGTGAGTGACAGACATTTTGAACAAAAACAATTCGGTCACCATAAACAAATGGCTTCTTTCCACTCCCTAATCCCTTGGAATTCATTATCCAGACCCATTTCTACACCCACTACTGATAGACAAATTACTCTTTCCACTTCCATCAATGGGATTGGAACCCATTTGTTCAGTCCTGTGCAATTTCGAGGCCACCATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989864
ATGGCTTCTTTCCACTCCCTAATCCCTTGGAATTCATTATCCAGACCCATTTCTACACCCACTACTGATAGACAAATTACTCTTTCCACTTCCATCAATGGGATTGGAACCCATTTGTTCAGTCCTGTGCAATTTCGAGGCCACCATGTTCATGGTGGGTGCAGATTTTCTTGGAATTCTCATGGAAAAAGTTTCAATCTTTATGCGTCTTCGTCTTCCTCCGGCGACGGGCTGGACGCAGCTGCTGTCAAAGAATACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769996.1
MASFHSLIPWNSLSRPISTPTTDRQITLSTSINGIGTHLFSPVQFRGHHVHGGCRFSWNSHGKSFNLYASSSSSGDGLDAAAVKEYKDDEFIVVNFYRFVFVKDPEYEVSKHLLFMKDRNIHGRIYLNEQGINAQFSGPSKDALAYVEWVKKDERFSDILIQISPAINGHAFPKLKLRYKPSLVQLEEGISHLPLLDPSMRATPLSPVEWRSKLEEASEIQNSSDTPNSNFVLLDVRNGYEWDVGHFKGAHRPDVDCFRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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