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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003152`

染色体: Chr06 坐标: 44522686-44525770 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003152`
名称	SmilChr06G003152
描述	BTB/POZ domain-containing protein At5g66560-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44522686 - 44525770 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989866`
GeneID	`130989866`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989866`
原始查询	`LOC130989866`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein At5g66560-like
产物	BTB/POZ domain-containing protein At5g66560-like
Arabidopsis	`AT5G66560` (AT5G66560) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836788] identity=60; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0767600` - identity=53; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989866

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057769999.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057769999.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057769999.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057769999.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44522932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:44522981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,D5
`Chr6:44523121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C36
`Chr6:44523700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:44523721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr6:44523865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C73,D6
`Chr6:44523867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,D1
`Chr6:44523914`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B125
`Chr6:44523914`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B125
`Chr6:44523917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr6:44523940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B82
`Chr6:44524086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C45,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769999.1

664 aa

332

664

NPH3

PF03000 NPH3 246-508 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769999.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	246	508	2.5e-89	300.1	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914016.1
AAAAATTGAAAGTTGCAACTGTGACGAGGCCAATGCAATCCCAGCAGCTTCAAATTAATAAATTAAACCTCATTTTGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTGCGTAGAGAGAGAAAACCACAGTTGGCAAGCAATGCAAATTTTTCTGGCGCTTGCTTTGCAGATAAATCATCACCATCTTCACTGCAATCATAGCTGCTGAAAGAAAAGGAGGAATTGTTTCCTAATATAAAGCAGAAATTCAAAGTCACTCTTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989866
ATGGCCGCCGAAAAACCCAGCTCCAAAGGGCAAGCATGGTTCTGCACCACGGGATTGCCGAGTGATGTGATAATCGAAGTTGATGACATGACTTTTCATCTCCACAAGTTTCCTCTGATGTCGAAAAGTCGAAAGCTTCACGAGCTGATTACAGAGCAAGAAAACAGCCAAGAAACTCGAAAAACAGCAAGGATCAAAGCACCCTCTGAACCCGACCACAATTCCGACAACGACATTGCAGAGAAAGAAGAAATACAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057769999.1
MAAEKPSSKGQAWFCTTGLPSDVIIEVDDMTFHLHKFPLMSKSRKLHELITEQENSQETRKTARIKAPSEPDHNSDNDIAEKEEIQEEEEEEEDDDAHCHITLADFPGGSESFETAAKFCYGVKIDLSAANAAPLRCAGEYLEMTEEYSEDNLILKTERFLSQSVLKNIKLSIKTLTSCEALLPMAEDLGIAQRCIEAVATKAAASDPSLFGWPMNDGATKNNDEANPRRKFSNAARGGAAAATESWLDELGFLSLPFFK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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