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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003170`

染色体: Chr06 坐标: 44647209-44648608 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003170`
名称	SmilChr06G003170
描述	B3 domain-containing protein REM-like 1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44647209 - 44648608 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989879`
GeneID	`130989879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989879`
原始查询	`LOC130989879`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein REM-like 1
产物	B3 domain-containing protein REM-like 1
Arabidopsis	`AT5G66980` (AT5G66980) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836832] identity=37.9; qcov=0.427; evalue=2.65e-10; confidence=low
Rice	`Os01g0723500` - identity=33.3; qcov=0.498; evalue=9e-12; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770009.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770009.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770009.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770009.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770009.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44647649`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	23	A20,A5,A7,B105,B112,B120,B131,B139,B21,B24,B26,B35,B68,B7,B75,B82,C10,C2,C22,C57,C59,C62,D8
`Chr6:44647652`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	23	A20,A5,A7,B105,B112,B120,B131,B139,B21,B24,B26,B35,B68,B7,B75,B82,C10,C2,C22,C57,C59,C62,D8
`Chr6:44647657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr6:44647806`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	A16,B120,B18,B22,B5,B99,C17,C5,C52,C77
`Chr6:44647898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:44647919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,C38
`Chr6:44648071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C87
`Chr6:44648140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B30,C83,C84
`Chr6:44648174`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A23
`Chr6:44648174`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A23
`Chr6:44648177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr6:44648202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C30,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770009.1

241 aa

120

241

PF02362 B3 11-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770009.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	11	100	2.8e-23	82.5	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914026.1
TAACAGAAGCTAGAAGGAAAAAATATTCGATCAACTCTCGCAGCTCAAAAACATGTATTGAAATCAAAAGGAGTTGAAGAGAGAAGACAACAATGTCTTGGAGATCAAAGGAAAAGCCTTCGTTTTTCAAGGTTCTCAGCAACATGGATTTCCGTAAGCTACTGCGTATGCCGCCTCATTTCTTGAGAAAATATGAGTTAACTCTGCCTGCAAATGTGAAGCTGAGAGTGGATGATTCTGGAAGAAGATGGAATGTGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989879
ATGTCTTGGAGATCAAAGGAAAAGCCTTCGTTTTTCAAGGTTCTCAGCAACATGGATTTCCGTAAGCTACTGCGTATGCCGCCTCATTTCTTGAGAAAATATGAGTTAACTCTGCCTGCAAATGTGAAGCTGAGAGTGGATGATTCTGGAAGAAGATGGAATGTGAGAGTGGAGCGAATGGATGATGGCTTGTTTTGCTTCACGAATGGTTGGGGGAAGTTTGCGGAAGATGCTGCTCTCAAACTCGGAGAATTTCTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770009.1
MSWRSKEKPSFFKVLSNMDFRKLLRMPPHFLRKYELTLPANVKLRVDDSGRRWNVRVERMDDGLFCFTNGWGKFAEDAALKLGEFLVFSVVAKSELNVVIYETSCWKREIPPVELNAYGLYVRKGANDVATSERNENSKESNPLYFKIHLRAFHKSRIMLPKPFSKAAKMKARKRVRLEYEGRHGGGGCFAAALRPQKTGRVDLGKGWYDFRVANGLRYDRVYSFEMKSDDDQVIHVKRLN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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