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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003166`

染色体: Chr06 坐标: 44613403-44615239 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003166`
名称	SmilChr06G003166
描述	B3 domain-containing protein Os11g0197600-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44613403 - 44615239 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989881`
GeneID	`130989881`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989881`
原始查询	`LOC130989881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein Os11g0197600-like
产物	B3 domain-containing protein Os11g0197600-like
Arabidopsis	`AT5G66980` (AT5G66980) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836832] identity=41.2; qcov=0.245; evalue=3.86e-09; confidence=weak
Rice	`Os01g0905400` - identity=39; qcov=0.36; evalue=3.67e-12; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989881

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770011.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770011.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770011.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770011.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770011.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44613719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B93
`Chr6:44613721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B135,B69,C62
`Chr6:44613769`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	160	A10,A13,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A25,A4,A5,A6,A7,A9,B10,B101,B103,B105,B106,B107,B108,B11,B111,B114,B117,B118,B119,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B129,B130,B131,B134,B135,B136,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B24,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B41,B42,B43,B45,B50,B51,B53,B54,B56,B6,B60,B62,B63,B64,B66,B68,B70,B73,B74,B75,B77,B79,B8,B80,B83,B85,B86,B88,B9,B90,B91,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C13,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C24,C25,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C4,C40,C43,C44,C47,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C7,C71,C72,C75,C76,C8,C81,C82,C83,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D5,D6,D7,D8
`Chr6:44613822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B73
`Chr6:44613822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr6:44613892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D11
`Chr6:44613893`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C82,D11
`Chr6:44613906`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr6:44613906`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr6:44614087`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	24	A1,A18,A3,A5,B10,B100,B102,B107,B129,B28,B49,B59,B65,B87,C12,C16,C29,C4,C48,C61,C62,C72,C78,D9
`Chr6:44614091`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	24	A1,A18,A3,A5,B10,B100,B102,B107,B129,B28,B49,B59,B65,B87,C12,C16,C29,C4,C48,C61,C62,C72,C78,D9
`Chr6:44614133`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B33,B71,B88,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770011.1

278 aa

139

278

PF02362 B3 11-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770011.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	11	97	9.8e-21	74.3	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914028.1
GTATCACTTTAAAAAGTAATGGAGATACTCTAATTGAAGCTCTCACCTCGATGGAGATGAAGCCACGAAGAAACCAAATCCAAATCCAAATCCAATGACTACAAGATCAAACGAAACGCCCTCATTTTTCAAGGTTCTGAGCAACGTGGATTACAGTAAGCTACTGCGTTTGCCGAGAAAATACGAGTTAACTCCGCCTGAGAATGTGAAGCTGAGAGCGGATGATTCTGGAAGAAGATGGAATGTGAGGGTGCAGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989881
ATGACTACAAGATCAAACGAAACGCCCTCATTTTTCAAGGTTCTGAGCAACGTGGATTACAGTAAGCTACTGCGTTTGCCGAGAAAATACGAGTTAACTCCGCCTGAGAATGTGAAGCTGAGAGCGGATGATTCTGGAAGAAGATGGAATGTGAGGGTGCAGCGAATGGATGATGGCTTGCTTTGCTTCACGAATGGTTGGGAGAAGTTTGCGGAAGATGCTGCTCTCAAACTCGGAGAATTTCTGGTTTTCTCTGTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770011.1
MTTRSNETPSFFKVLSNVDYSKLLRLPRKYELTPPENVKLRADDSGRRWNVRVQRMDDGLLCFTNGWEKFAEDAALKLGEFLVFSVVAKSEFSVLIYETSSCKREIPNPSSFTDWSNSHGGGDEIESGIKRRRGRPPLNRKRETTLEIPPSRRSRVEVKSQVKGICKRNGYSKKSDPLCFERLLKTHHRSLLTLPKKFMVATNMRMKKQVGMKYVGNCRGGVSHVVVAPRLQKDRIDLGEGWRKFRVANGIEFGKTYSFR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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