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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003193`

染色体: Chr06 坐标: 44820423-44826692 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003193`
名称	SmilChr06G003193
描述	histone deacetylase 14, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44820423 - 44826692 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989905`
GeneID	`130989905`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989905`
原始查询	`LOC130989905`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase 14, chloroplastic
产物	histone deacetylase 14%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G33470` (HDA14) histone deacetylase 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829484] identity=73.8; qcov=0.899; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0182700` (OsHDAC10) - identity=72.8; qcov=0.833; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00850 (Hist_deacetyl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989905

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057770048.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057770048.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770048.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770048.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770048.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44820772`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:44820845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr6:44820905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B22,B54,C5
`Chr6:44821181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C15,C47
`Chr6:44821193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D7
`Chr6:44821879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B86
`Chr6:44822627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C82
`Chr6:44822652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr6:44823542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B115,B72
`Chr6:44824259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:44825611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B36,C23
`Chr6:44825658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B80,C29,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770048.1

437 aa

218

437

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 94-398 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770048.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	94	398	1.5e-91	307.6	Histone deacetylase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914065.1
GGGTGGGAGGGAGTATATAGCATATCATCTTCTCATTTGAAAATATCTTTGGTGTGTTTGTGATACTGAATGGAGCTCAGCGCCTTCTACTCTCCATTTTCTGTTGGAAATGTATTCTACCCAAGTAGGTCTCGTTTGTGCTGGTTGAAGAAACATTGCATCTATGGGTTTGGATCTCTGGAGAAAAATGTGAAGCCTATAAGAGCATATTCCATACGAACAAAATGGAGTTCTGTTTGTTGTTCTAGTAATCCAGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989905
ATGGAGCTCAGCGCCTTCTACTCTCCATTTTCTGTTGGAAATGTATTCTACCCAAGTAGGTCTCGTTTGTGCTGGTTGAAGAAACATTGCATCTATGGGTTTGGATCTCTGGAGAAAAATGTGAAGCCTATAAGAGCATATTCCATACGAACAAAATGGAGTTCTGTTTGTTGTTCTAGTAATCCAGAAATGAATCATTTTTCACCTTCTGAAATAGAGCTGCTCAATGGCAAAGTCATATATTCAGTCGCTGCTGCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770048.1
MELSAFYSPFSVGNVFYPSRSRLCWLKKHCIYGFGSLEKNVKPIRAYSIRTKWSSVCCSSNPEMNHFSPSEIELLNGKVIYSVAAAMGHNKESHPECNSRVPAIIDALEKMKLTSEFRGMDIIELENFRPAKVEDIARVHERAYVSGLEKAMDQASEQGLILIEGSGPTYATSTTFQESLLAAGAGISLVDAVVAASKIRKDPPVGFALVRPPGHHAVPTGPMGFCVFGNVAIAARYAQRAHGLKRIFIIDFDVHHGNGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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