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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003201`

染色体: Chr06 坐标: 44857057-44862838 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003201`
名称	SmilChr06G003201
描述	uncharacterized SmilChr06G003201
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44857057 - 44862838 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989910`
GeneID	`130989910`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989910`
原始查询	`LOC130989910`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA polymerase alpha 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843086]; symbol=POLA2; hit=AT1G67630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DNA polymerase alpha 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843086]; symbol=POLA2; hit=AT1G67630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G67630` (POLA2) DNA polymerase alpha 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843086] identity=56; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0242900` - identity=53.1; qcov=0.657; evalue=1.21e-153; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005658 (alpha DNA polymerase:primase complex); GO:0006260 (DNA replication); GO:0006270 (DNA replication initiation)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04042 (DNA_pol_E_B); PF08418 (Pol_alpha_B_N); PF22062 (OB_DPOA2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989910

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770051.1`
2	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057770051.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057770051.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057770051.1`
5	PML body	PML body	0.20000	`XP_057770051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44857467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:44857491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:44857797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,D1,D9
`Chr6:44858471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C84
`Chr6:44858472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C76,D2
`Chr6:44858791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:44858916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C39
`Chr6:44858924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B140,C8
`Chr6:44859883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C39
`Chr6:44859902`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr6:44859902`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr6:44859904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770051.1

616 aa

308

616

Pol_alpha_B_N

OB_DPOA2

DNA_pol_E_B

PF08418 Pol_alpha_B_N 4-52 aa PF22062 OB_DPOA2 237-316 aa PF04042 DNA_pol_E_B 355-564 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770051.1`	Pfam	`PF08418`	Pol_alpha_B_N	Domain	4	52	3.4e-08	34.0	DNA polymerase alpha subunit B N-terminal
`XP_057770051.1`	Pfam	`PF22062`	OB_DPOA2	Domain	237	316	1.1e-21	77.6	DNA polymerase alpha subunit B, OB domain
`XP_057770051.1`	Pfam	`PF04042`	DNA_pol_E_B	Family	355	564	2.5e-46	158.5	DNA polymerase alpha/epsilon subunit B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914068.1
GCCATTTACTACCACTGGTCTTCGTTGAAAGTTGAAACTCGAAAGAAACCCTACTGCTACTGAGCTCCACATCCCCGCGAAAATGGAAGGTGAAATCAAAGCAGAATTCACCAAGGGCGGCTTTACTCTCGACGAAGAAGAAGAGATTCTCCAGAAATGTCTGACATTTTGTATACAATACAAGCTCAGCGCGTCGGACATTGTCGCCAACTGGGATTTGTACTCTATCAACAGGGGCCTGGATTCTGTAGTACGAAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989910
ATGGAAGGTGAAATCAAAGCAGAATTCACCAAGGGCGGCTTTACTCTCGACGAAGAAGAAGAGATTCTCCAGAAATGTCTGACATTTTGTATACAATACAAGCTCAGCGCGTCGGACATTGTCGCCAACTGGGATTTGTACTCTATCAACAGGGGCCTGGATTCTGTAGTACGAAGCTCACATATGGGTGCATTTTTAGAGCAGTTGCAGAATGAACAGGTGGATAAAGTCAAAGAGAAAGCATCCGGGTTGCACCTGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770051.1
MEGEIKAEFTKGGFTLDEEEEILQKCLTFCIQYKLSASDIVANWDLYSINRGLDSVVRSSHMGAFLEQLQNEQVDKVKEKASGLHLYSNDVAMILNGNYGETEAILDTPPDKHTSALQKSSDSAQKTNSIKLTSKKPLEPVTPFGSRKNKFVIQLTLNEHLDMQTIKAEDDDANSEDDIIKRVQPSKECSLVINRSQPEPGCRFMYDRIEDKFNFLENCIKRRATAYVSSGRYDEPVDPSVASQQRIFAVGMICCEEEGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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