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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003206`

染色体: Chr06 坐标: 44881678-44888094 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003206`
名称	SmilChr06G003206
描述	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44881678 - 44888094 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989912`
GeneID	`130989912`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989912`
原始查询	`LOC130989912`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
产物	protein MODIFIED TRANSPORT TO THE VACUOLE 1-like
Arabidopsis	`AT3G16270` (AT3G16270) ENTH/VHS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820873] identity=53.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0232400` - identity=46.5; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0032588 (trans-Golgi network membrane); GO:0035091 (phosphatidylinositol binding); GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF01417 (ENTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989912

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057770057.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057770057.1`
3	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057770057.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057770057.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44882935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B17,B56,B96,D4
`Chr6:44883018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B37,B83,C13,C59
`Chr6:44883324`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:44883376`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A5,B125,B33,B71,B91,C18,C20,C80,C86,C87,D6,D7
`Chr6:44883386`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	31	A11,A21,A9,B103,B106,B114,B117,B122,B126,B127,B129,B28,B32,B40,B49,B58,B6,B74,B76,B88,B97,C28,C4,C50,C58,C67,C72,C83,C84,C85,D3
`Chr6:44883471`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A13,C38
`Chr6:44883471`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A13,C38
`Chr6:44883481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr6:44883600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr6:44883653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B92,B94
`Chr6:44886207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B59
`Chr6:44886463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770057.1

699 aa

350

699

ENTH

PF01417 ENTH 16-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770057.1`	Pfam	`PF01417`	ENTH	Repeat	16	129	6e-08	33.5	ENTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914074.1
TTTAAAATTATTATTATTATTAAATTATTATTTTTTTGTACATTTCTCTTACAAAAAAAAAACAAAACAAAAACCCTTGAGAAACATCATCCCTTTCCGATCATTGATTTGTTCAATTTTTTGGTTGGATTCGTTCAATTTTGCGCAGGAAGACCAAATTCCACCCAAATTCGCCTCTTCTACGGTTCCAAGTTTGTCCTTTCAGTTTGAATTGATTAATTATTGAATTAATTTGATCAGTAATTGGAGCGGTTGCGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989912
ATGGAGCAGAGCAGGAGAGCGGTAGAGTCGTATTGGAGGTCAAGAATGGTGGACGGCGCCACGTCCGATGAGGATAAGGTGACTCCGGTTTACAAATTGGAAGAAATTTGCGATTTGCTGAGGTCGTCGCACCCCTCCATCGTTAAGGAAGTCTCCGAGTTTATTCTCAAGCGTCTCGACCACAAATCGTCTATTGTTAAGCAGAAGGCCTTAAGAGTCATCAAATATGCAGTGGGAAAGTCAGGTGCTGAGTTCAGAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770057.1
MEQSRRAVESYWRSRMVDGATSDEDKVTPVYKLEEICDLLRSSHPSIVKEVSEFILKRLDHKSSIVKQKALRVIKYAVGKSGAEFRREMQRNSVAVRQLIHYRGQPDPLKGNALNKAVRETAQETLSVLFTSDESKAAPTESKLGSRIQGFGNTNYELPSEDKRSFINEIVDIGSATIKQGLSNLAQSPSLRKNNDTGSYRSPNLQRSLAPERDHSERYEAVNYNTDMQSSSRFSKNAGSGSWGQDLSASQAETSDGVYE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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