当前解析结果
SmilChr01G000816| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000816 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000816 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000816 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 17602212 - 17602676 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130989921 |
|---|---|
| GeneID | 130989921 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130989921 |
| 原始查询 | LOC130989921 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130989921 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770104.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057770104.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770104.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770104.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770104.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:17602249 |
TCC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 8 | A18,B110,B124,B16,B6,B8,C22,C67 |
Chr1:17602373 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B60 |
Chr1:17602374 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B132 |
Chr1:17602383 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr1:17602392 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B56,B86 |
Chr1:17602409 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B57,C83 |
Chr1:17602409 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B57,C83 |
Chr1:17602424 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 36 | A10,A18,A22,A23,A3,A4,A7,B105,B109,B112,B119,B19,B23,B26,B38,B39,B41,B47,B57,B59,B6,B67,B69,B81,B95,C12,C14,C17,C29,C34,C41,C46,C54,C62,C74,D3 |
Chr1:17602430 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A24,A5,B126,B138,B23,B32,B42,B43,C3,C48,D5,D8 |
Chr1:17602476 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B123,B22,B67,C34 |
Chr1:17602479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B66 |
Chr1:17602485 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B57,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。