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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003212`

染色体: Chr06 坐标: 44917616-44969930 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003212`
名称	SmilChr06G003212
描述	uncharacterized SmilChr06G003212
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	44917616 - 44969930 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989922`
GeneID	`130989922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989922`
原始查询	`LOC130989922`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0192200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0192200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0192200` - identity=38.1; qcov=0.186; evalue=1.57e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770072.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770072.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770072.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770072.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:44967767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr6:44968095`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770072.1

339 aa

N

1

170

339

DBD_Tnp_Mut

C

PF03108 DBD_Tnp_Mut 211-268 aa

XP_057770073.1

339 aa

N

1

170

339

DBD_Tnp_Mut

C

PF03108 DBD_Tnp_Mut 211-268 aa

XP_057770074.1

339 aa

N

1

170

339

DBD_Tnp_Mut

C

PF03108 DBD_Tnp_Mut 211-268 aa

XP_057770075.1

339 aa

N

1

170

339

DBD_Tnp_Mut

C

PF03108 DBD_Tnp_Mut 211-268 aa

XP_057770076.1

339 aa

N

1

170

339

DBD_Tnp_Mut

C

PF03108 DBD_Tnp_Mut 211-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770072.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	211	268	3e-10	40.3	MuDR family transposase
`XP_057770073.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	211	268	3e-10	40.3	MuDR family transposase
`XP_057770074.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	211	268	3e-10	40.3	MuDR family transposase
`XP_057770075.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	211	268	3e-10	40.3	MuDR family transposase
`XP_057770076.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	211	268	3e-10	40.3	MuDR family transposase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA

XR_009090789.1
TTGTAAAATTGCATACGCACTTTTTTTAAAATATAAATACTCGACCTTTTATATTTTCTGATTTCACTCATAATTTTAAAGTTCCTCAAATTAAAATTGAGTTAAGCAGTAGAAAAGATCAACGTGATCAAATCGACAATAAAAAAAAGGGTTAAATAGCAAATACACCCCTAACGTTTATCGCAAAAAGCAAATAGGTCCTTAACGTTATGTTTTGTGCAACTAAATCCCTAATGTTCATAAATTGGGGCAAATAGATC...

XR_009090786.1
TGTAAAATTGCATACGCACTTTTTTTAAAATATAAATACTCGACCTTTTATATTTTCTGATTTCACTCATAATTTTAAAGTTCCTCAAATTAAAATTGAGTTAAGCAGTAGAAAAGATCAACGTGATCAAATCGACAATAAAAAAAAGGGTTAAATAGCAAATACACCCCTAACGTTTATCGCAAAAAGCAAATAGGTCCTTAACGTTATGTTTTGTGCAACTAAATCCCTAATGTTCATAAATTGGGGCAAATAGATCC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC130989922
ATGACTCAAGATTGTTCCGTCAACAAAAGCTTGTCCGAGAATAGAGATTTTTGGTTTAATTTTGATGGCTATTGGGAAAAAATTGGAACTTGGGTTTATAAATGTTGGGATGCAGATATTGTGAGTGATAAAGTGAGCAAAATGACTTTTGATCGTATCAAGAAACATTTTTCTGACTTGGGGTATCCGAATCCTAAAGCTATATGTGTTCGTGACCCTGATAAAAATTTCAAAGAGGGTTTGTATCTAATTGAGGATGA...

LOC130989922
ATGACTCAAGATTGTTCCGTCAACAAAAGCTTGTCCGAGAATAGAGATTTTTGGTTTAATTTTGATGGCTATTGGGAAAAAATTGGAACTTGGGTTTATAAATGTTGGGATGCAGATATTGTGAGTGATAAAGTGAGCAAAATGACTTTTGATCGTATCAAGAAACATTTTTCTGACTTGGGGTATCCGAATCCTAAAGCTATATGTGTTCGTGACCCTGATAAAAATTTCAAAGAGGGTTTGTATCTAATTGAGGATGA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057770072.1
MTQDCSVNKSLSENRDFWFNFDGYWEKIGTWVYKCWDADIVSDKVSKMTFDRIKKHFSDLGYPNPKAICVRDPDKNFKEGLYLIEDEESCRKSLQYIEVLNVEKVEFFIDDDNMPLPDDITPSILLVPTMCSDGNNIESERVQELVDVRVVSQYNWQESEYVNPVGYISEEDDAYDDGEFVSEDNGTETEDDTNVDDDIENLANDSGYFMLGRTFADVKEAREAIHEYGVKFGYKLKFVKNDTTRVRVHCGNELNCPFKL...

XP_057770073.1
MTQDCSVNKSLSENRDFWFNFDGYWEKIGTWVYKCWDADIVSDKVSKMTFDRIKKHFSDLGYPNPKAICVRDPDKNFKEGLYLIEDEESCRKSLQYIEVLNVEKVEFFIDDDNMPLPDDITPSILLVPTMCSDGNNIESERVQELVDVRVVSQYNWQESEYVNPVGYISEEDDAYDDGEFVSEDNGTETEDDTNVDDDIENLANDSGYFMLGRTFADVKEAREAIHEYGVKFGYKLKFVKNDTTRVRVHCGNELNCPFKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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