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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003243`

染色体: Chr06 坐标: 45122132-45125587 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003243`
名称	SmilChr06G003243
描述	L-ascorbate oxidase homolog
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45122132 - 45125587 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989954`
GeneID	`130989954`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989954`
原始查询	`LOC130989954`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase homolog
产物	L-ascorbate oxidase homolog
Arabidopsis	`AT5G66920` (sks17) SKU5 similar 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836826] identity=72.9; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0119400` (OsAAO3) - identity=66; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989954

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057770117.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770117.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770117.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770117.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770117.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45122967`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,D2
`Chr6:45123307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,C16,C18,C48,C87
`Chr6:45124055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,D10,D11
`Chr6:45124062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:45124076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr6:45124197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C41
`Chr6:45124260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B41,B46,C42,C82
`Chr6:45124278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C8
`Chr6:45124289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C45
`Chr6:45124328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B104,B78,C32,C68
`Chr6:45124545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr6:45124626`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C82,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770117.1

538 aa

269

538

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 34-147 aa PF00394 Cu-oxidase 160-295 aa PF07731 Cu-oxidase_2 375-513 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770117.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	34	147	1.7e-40	138.5	Multicopper oxidase
`XP_057770117.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	160	295	1.2e-42	146.4	Multicopper oxidase
`XP_057770117.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	375	513	1.9e-34	119.1	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914134.1
ACTTTAACCGCCAACCACCCTTTTCTTCTACGTTTCGGCGGATTAACAAACCAATTGAGTTGGTTTGTAAACAAACATGGAAGGAAAATAATTAAACATGCATTCATAATAACGCGGAAACGCGTCAATTAGCATATACCATGAGTTGGCAATGGCAATGCGAGACAGCCATGCGGCCCGCTTCCTCCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTCCAATTTTCTCAAAGCTGCTGTCTCTGTTGCCTAATCATTTTTTATATATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989954
ATGGGGGGAGCAGTTTTGCTGTGTTTGGTTGCTGTTTTCTCGTTTTGGAGTTTCTCTTTTGTGAGAGGAGAGGATGCTTACAAGTATTACACTTGGACTGTCACTTATGGAGCTGCTTCTCCACTTGGCCCTTCTCAACAGGTGATCTTGATAAACGGTCAGTTTCCTGGCCCTACGCTTGAGACTGTGACCAATGACAACATTATCCTCAACGTTATCAATAAGTTGGACCAGCCTTTCCTCTTGACATGGAATGGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770117.1
MGGAVLLCLVAVFSFWSFSFVRGEDAYKYYTWTVTYGAASPLGPSQQVILINGQFPGPTLETVTNDNIILNVINKLDQPFLLTWNGIKQRKNSWQDGVVGTNCPIPPNTNFTYKFQTKDQIGSYTYFPSTLMHRAAGGFGALNVYARSVIPVPYAKPAADYSLLIGDWYKTSHRVLQQILDSGKALPFPDGILINGQGRPAFRGDQGKTYMFRVSNVGLSTSFNFRIQGHKMKLVEVEGSHVLQNVYDSLDIHVGQSVTI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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