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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003256`

染色体: Chr06 坐标: 45221376-45226796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003256`
名称	SmilChr06G003256
描述	uncharacterized SmilChr06G003256
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45221376 - 45226796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989969`
GeneID	`130989969`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989969`
原始查询	`LOC130989969`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DDT domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830764]; symbol=AT5G08630; hit=AT5G08630; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	DDT domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830764]; symbol=AT5G08630; hit=AT5G08630; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G08630` (AT5G08630) DDT domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830764] identity=44.1; qcov=1.07; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os02g0556900` - identity=41.9; qcov=0.999; evalue=0; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02791 (DDT); PF10537 (WAC_Acf1_DNA_bd); PF15613 (WSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989969

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770137.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057770137.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770137.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770137.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770137.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45223637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr6:45224318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C41
`Chr6:45224748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C80
`Chr6:45225066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B121,B91
`Chr6:45226420`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B126,B6,C63,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770137.1

702 aa

351

702

WAC_Acf1_DNA_bd

DDT

WSD

PF10537 WAC_Acf1_DNA_bd 24-129 aa PF02791 DDT 314-371 aa PF15613 WSD 581-647 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770137.1`	Pfam	`PF10537`	WAC_Acf1_DNA_bd	Domain	24	129	6.2e-28	97.9	ATP-utilising chromatin assembly and remodelling N-terminal
`XP_057770137.1`	Pfam	`PF02791`	DDT	Family	314	371	1.2e-19	70.9	DDT domain
`XP_057770137.1`	Pfam	`PF15613`	WSD	Family	581	647	1e-26	93.6	Williams-Beuren syndrome DDT (WSD), D-TOX E motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914154.1
ATGCCTCTTTTGAAAAGAAGGCCATTTATTTTAATTGAGAAGCCTGAGGATTTAAACCCTAATGAGCTTGTCTTTCAAATCCGGTTCACAAAGGAAATCTTCAGGAGTTATAATGAATATTTGAAGAGGATCAACTTATATCGCAAAAGTGTCTGGACATGCAAAGCCACAGGGAAGGAACACTTGACCTATGAAGAAGCCTTGGTATCAGAAGAAAAAGCTTCTAAAAGAAAACAAAATGAAGCTTCTAAAGGAATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989969
ATGCCTCTTTTGAAAAGAAGGCCATTTATTTTAATTGAGAAGCCTGAGGATTTAAACCCTAATGAGCTTGTCTTTCAAATCCGGTTCACAAAGGAAATCTTCAGGAGTTATAATGAATATTTGAAGAGGATCAACTTATATCGCAAAAGTGTCTGGACATGCAAAGCCACAGGGAAGGAACACTTGACCTATGAAGAAGCCTTGGTATCAGAAGAAAAAGCTTCTAAAAGAAAACAAAATGAAGCTTCTAAAGGAATACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770137.1
MPLLKRRPFILIEKPEDLNPNELVFQIRFTKEIFRSYNEYLKRINLYRKSVWTCKATGKEHLTYEEALVSEEKASKRKQNEASKGIQYVPAEYVAPILHDVQFSMLNLKDLVNSIASKFQGPLTKGDEVYGRKDGRLHLCKIVKVVEVADIKQYEIEWLGHDKTISGKALVNGDELKVKNPPFSKRALKFFIKDSTYRSLPWVLHDNLSKKHGISTIPPEEMKSDISLQNGLVVCSRKRKKREETQSAKVASEKGIIVYV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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