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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003257`

染色体: Chr06 坐标: 45228062-45237130 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003257`
名称	SmilChr06G003257
描述	protein PSK SIMULATOR 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45228062 - 45237130 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989970`
GeneID	`130989970`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989970`
原始查询	`LOC130989970`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PSK SIMULATOR 1-like
产物	protein PSK SIMULATOR 1-like
Arabidopsis	`AT1G34320` (AT1G34320) Ikzf5 (DUF668) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840333] identity=60.4; qcov=0.803; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0430300` - identity=57.5; qcov=0.764; evalue=1.09e-173; confidence=high
GO	GO:0045927 (positive regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF05003 (DUF668); PF11961 (DUF3475)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989970

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770138.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770138.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057770138.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770138.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770138.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45228623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:45228679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C83
`Chr6:45228767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr6:45229094`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B108,B61,C23,D3
`Chr6:45229094`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B108,B61,C23,D3
`Chr6:45229305`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	190	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B1,B10,B101,B102,B103,B104,B105,B108,B109,B111,B112,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B121,B125,B126,B127,B130,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B71,B72,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B88,B89,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C16,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C32,C33,C34,C36,C38,C39,C40,C42,C44,C47,C49,C50,C51,C54,C56,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D11,D3,D4,D5,D8,D9
`Chr6:45229378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:45229770`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B84
`Chr6:45229770`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B84
`Chr6:45229774`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr6:45231066`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	91	A11,A13,A21,A22,A25,A3,A5,A6,A7,A8,B10,B104,B112,B113,B118,B119,B12,B121,B127,B130,B131,B132,B137,B139,B15,B16,B17,B18,B22,B24,B26,B28,B30,B37,B4,B42,B43,B44,B46,B51,B52,B54,B57,B58,B62,B65,B69,B71,B74,B76,B77,B79,B8,B83,B86,B91,B98,C1,C12,C15,C16,C2,C21,C26,C27,C3,C34,C36,C38,C40,C44,C47,C49,C50,C51,C54,C56,C59,C62,C63,C65,C7,C70,C71,C74,C77,C79,C80,C86,D3,D4
`Chr6:45234814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770138.1

588 aa

294

588

DUF3475

DUF668

PF11961 DUF3475 180-236 aa PF05003 DUF668 402-489 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770138.1`	Pfam	`PF11961`	DUF3475	Family	180	236	2.5e-19	69.8	Domain of unknown function (DUF3475)
`XP_057770138.1`	Pfam	`PF05003`	DUF668	Family	402	489	1.8e-30	105.9	Protein of unknown function (DUF668)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914155.1
CATTGACCGATTCCTAGTCAAAGGCAGTCGGTAGCCATTGCCATCATAACACAGCCACCTTCCTCCATTTCCACTAACTAATTTTTATATTCAACTTCGTCTTCTTCCGCCTTAATTAATTCACTACCAGATTCTACAGCTACTTCCACACTTCAATCAAAATCTTAATCGACATATGTTTTAATAGCTCCTTGTTTTTAATACTAGTAATTTGTTTTTTCCTTGATATAAACAATCAATATTTTTTTGGCGCGTCTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130989970
ATGGGAGCGCTGTGTTCGAAGCCGAAGCCGAAATCGACGGCAAACCCGTACGCGGGCAGAAGCACGGGCCTAGAGAAGCAGTTTCATCAGGAGCGGCGGCAGCGGCAGCGAGAGATGCAGAGAGAAACCAGTAAGATTGCGACAGCTCAGCCGACGGTGCAGGAGCCCGTGGAGGCTGCTAAAGAGTCGCCGAGGTTGTCGGCTTCTAAAGAGTCGCCGAGGAGTTCGGCTGCTAGGGAATCGCCAAGGTTTTCGGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770138.1
MGALCSKPKPKSTANPYAGRSTGLEKQFHQERRQRQREMQRETSKIATAQPTVQEPVEAAKESPRLSASKESPRSSAARESPRFSASKESPRGSARFSTASDDEFYDGIPRYQKSSSYLKSRSLRSAKVSEVSSRLGRAGSAGFGRAVEVLDSLGSSVSNLNIKGGFVSGATNKSNELSILSFEVANTIVKGSSLMQSLSKRSIRQLEEIVLPEKGVQQLVTNDMDELLRIVASDKREELKVFAGEIIRFGNRCKDPQWH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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