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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G003288`

染色体: Chr06 坐标: 45437919-45439444 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G003288`
名称	SmilChr06G003288
描述	probable aspartic proteinase GIP2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	45437919 - 45439444 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990002`
GeneID	`130990002`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990002`
原始查询	`LOC130990002`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aspartic proteinase GIP2
产物	probable aspartic proteinase GIP2
Arabidopsis	`AT1G03220` (AT1G03220) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838517] identity=43.3; qcov=1; evalue=7.25e-102; confidence=medium
Rice	`Os05g0403000` - identity=39.3; qcov=0.961; evalue=4.03e-89; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990002

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057770167.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057770167.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057770167.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770167.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770167.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:45438086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr6:45438100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr6:45438140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C48
`Chr6:45438217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B12,C82,D4
`Chr6:45438232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B46,B76,D2
`Chr6:45438286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B70
`Chr6:45438310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C40
`Chr6:45438457`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B38
`Chr6:45438457`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B38
`Chr6:45438643`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A11,A13,A5,B49,B51,B61,C1,C27,C31,C44,C61,C62,C71,D7
`Chr6:45438718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:45438722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770167.1

432 aa

216

432

TAXi_N

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 43-214 aa PF14541 TAXi_C 252-416 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770167.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	43	214	2.1e-27	97.1	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057770167.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	252	416	1.3e-53	181.8	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914184.1
CTTCATCCATTACCAGTATAAATAACTAACAACTATTAACTCAATATATCAAAGAACGAAGATAATGGCTTCTCCCACTCTCTCCATCTTCATAATTTCCTCTTTGCTCATTGTATCTTCTTTCTCAAACGCTCAACCAAAACCTAAAGCCTTCACTTTCCCAATTAGGAAAGACGACGCAACCAACCAATACTACACAACTATCCAACTAGGCTCCAACGCCACCACACTGAACGTGGGGATCGATCTCGGCGGCAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990002
ATGGCTTCTCCCACTCTCTCCATCTTCATAATTTCCTCTTTGCTCATTGTATCTTCTTTCTCAAACGCTCAACCAAAACCTAAAGCCTTCACTTTCCCAATTAGGAAAGACGACGCAACCAACCAATACTACACAACTATCCAACTAGGCTCCAACGCCACCACACTGAACGTGGGGATCGATCTCGGCGGCAATTTCCTATGGTTCAACTCCCTCGACTACTTCTCCGCCGCCGACACCTACCGCCCCATCCTTTGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770167.1
MASPTLSIFIISSLLIVSSFSNAQPKPKAFTFPIRKDDATNQYYTTIQLGSNATTLNVGIDLGGNFLWFNSLDYFSAADTYRPILCGTKQCRIANGVGCIFCFLSPPVPGCTNNTCSDYSLNPFTGTQGYSGLGQDVLRVSSTRGAHYKLNDFPFQFSDPVLREALAAPTVGLLALGRTRVSLPAQLSSAFKISEKFALCIPSSGGNGNMIIGDEVYRKPFQQISEAIQTTPLLRNPVSTYGNEVTGNLSIAYFIDVRSI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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